(19)国家知识产权局 (12)发明 专利 (10)授权公告 号 (45)授权公告日 (21)申请 号 20221045717 7.9 (22)申请日 2022.04.28 (65)同一申请的已公布的文献号 申请公布号 CN 114561496 A (43)申请公布日 2022.05.31 (73)专利权人 北京生物制品研究所有限责任公 司 地址 100176 北京市大兴区北京经济技 术 开发区博兴二路9号院4 号楼2层205室 (72)发明人 杨晓明　王辉　赵玉秀　梁宏阳　 王展慧　贺瑶　何振玉　郭彦岑　 (74)专利代理 机构 北京三友知识产权代理有限 公司 11127 专利代理师 韩蕾　张德斌(51)Int.Cl. C12Q 1/70(2006.01) C12Q 1/686(2018.01) C12N 15/11(2006.01) 审查员 陶然 (54)发明名称 鉴别新型冠状病毒Delta株的引物、 探针及 其应用 (57)摘要 本发明提供了一种鉴别新型冠状病毒Delta 株的引物、 探针及其应用。 本发明的引物包括如 SEQ ID NO.1所示序列的引物和如SEQ  ID NO.2 所示序列的引物。 本发明的探针包括如SEQ  ID  NO.3所示序列的探针。 利用本发明的引物和探 针， 可通过PCR方法对新型冠状病毒Delta株和其 它毒株进行鉴别。 权利要求书1页 说明书5页 序列表2页 附图3页 CN 114561496 B 2022.08.19 CN 114561496 B 1.一种用于双重探针qPCR方法鉴别新型冠状病毒Delta株的引物和探针的组合物， 其 特征在于， 所述引物包括如SEQ  ID NO.1所示序列的引物和如SEQ  ID NO.2所示序列的引 物： SEQ ID NO.1： 5’ ‑GTTTATTACCACAAAAACAACAAAAG‑3’； SEQ ID NO.2： 5’ ‑CATATTCAAAAGTGCAATTATTCGC‑3’； 所述探针包括如SEQ  ID NO.3所示序列的探针和如SEQ  ID NO.4所示序列的探针： SEQ ID NO.3： 5’ ‑GATGGAAAGTGGAGTTTATTC‑3’； SEQ ID NO.4： 5’ ‑GGAAAGTGAGTTCAGAGTTTATTC‑3’； 所述探针是经荧光基团修饰的， 所述修饰包括： 探针序列5 ’端碱基采用荧光报告基团 修饰， 同时探针序列3 ’端碱基采用荧光淬灭基团修饰； 其中， 如SEQ  ID NO.3所示序列的探 针5’端碱基采用荧光报告基团FAM修饰， 如SEQ  ID NO.4所示序列的探针5 ’端碱基采用荧光 报告基团C Y5修饰。 2.一种用于双重探针qPCR方法鉴别新型冠状病毒Delta株的试剂盒， 其特征在于， 所述 试剂盒包 含： 权利要求1所述的引物和探针的组合物。 3.根据权利要求2所述的试剂 盒， 其特征在于， 所述试剂 盒还包括阳性质控 品和阴性质 控品； 所述阳性质控品包括新型冠状病毒Delta株S基因标准质粒模板， 所述阴性质控品包 括Delta株外其它新型 冠状病毒S基因标准质粒模板 。 4.一种非诊断目的的权利要求1所述的引物和探针的组合物或权利要求2或3所述的试 剂盒在体外双重 探针qPCR方法鉴别样品中是否存在新型 冠状病毒Delta株的应用。 5.根据权利要求4所述的应用， 其特征在于， 通过PCR反应鉴别样品中是否存在新型冠 状病毒Delta株， 所述引物在PCR反应体系中的终浓度为0.1 ‑10 μM， 所述探针在PCR反应体系 中的终浓度为0.1 ‑10 μM。 6.根据权利要求4所述的应用， 其特征在于， 其中如SEQ  ID NO.3所示序列的探针的扩 增曲线为S型曲线， 鉴定为 新型冠状病毒Delta株阳性。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114561496 B 2鉴别新型冠状病毒Delta 株的引物、 探针及其应用 技术领域 [0001]本发明是关于一种鉴别新型冠状病毒Delta株的引物、 探针及其应用， 更具体地说 是关于一种针对新型冠状病毒Delta株S基因Δ156 ‑157突变位点的引物、 探针、 试剂盒和检 测方法， 属于分子生物学检测技 术领域。 背景技术 [0002]新型冠状病毒 （SARS ‑CoV‑2） 感染可引起呼吸道症状、 发热、 咳嗽、 气促和呼吸困难 等， 严重者可导致新型冠状病毒肺炎 （COVID ‑19） 。 随着新型冠状病毒在人群中的传播， 病毒 基因组发生了许多突变， 其中发生在保护性抗原S蛋白关键氨基酸位点的突变， 可能导致病 毒的传播能力和致病性增强， 并且降低现有疫苗的保护效果。 相比原型株， 新型冠状病毒 Delta株的传染性和传播能力显著增强， 在人体内的病毒载量高， 且在身体内的潜伏期缩 短。 [0003]因此， 快速、 准确地 鉴别新型 冠状病毒Delta株具有重要意 义。 发明内容 [0004]本发明的一个目的在于提供一种用于鉴别新型 冠状病毒Delta株的引物。 [0005]本发明的另一目的在于提供一种用于鉴别新型 冠状病毒Delta株的探针。 [0006]本发明的另一目的在于提供一种用于鉴别新型 冠状病毒Delta株的试剂盒。 [0007]本发明的另一目的在于提供所述引物、 探针或试剂盒用于鉴别新型冠状病毒 Delta株的相关应用。 [0008]一方面， 本发明提供了一种鉴别新型冠状病毒Delta株的引物， 其包括如SEQ  ID  NO.1所示序列的引物和如SEQ  ID NO.2所示序列的引物： [0009]SEQ ID NO.1： 5’ ‑GTTTATTACCACAAAAACAACAAAAG‑3’； [0010]SEQ ID NO.2： 5’ ‑CATATTCAAAAGTGCAATTATTCGC‑3’。 [0011]本发明的鉴别新型冠状病毒Delta株的引物 是针对新型冠状病毒Delta株S蛋白而 设计。 相比于原型株， 新型冠状病毒Delta株的突变位点包括： T19R、 Δ156 ‑157、 R158G、 L452R、 T478K、 D614G、 P681R、 D950N等。 具体而言， 本发明的鉴别新型冠状病 毒Delta株的引 物是基于 Δ156‑157突变位 点而设计。 [0012]另一方面， 本发明还提供了一种鉴别新型冠状病毒Delta株的探针， 所述探针包 括： [0013]如SEQ ID NO.3所示序列的探针： [0014]SEQ ID NO.3： 5’ ‑GATGGAAAGTGGAGTTTATTC‑3’。 [0015]根据本发明的具体实施方案， 所述探针还 包括： [0016]如SEQ ID NO.4所示序列的探针： [0017]SEQ ID NO.4： 5’ ‑GGAAAGTGAGTTCAGAGTTTATTC‑3’。 [0018]如SEQ ID NO.3所示序列的探针是基于新型冠状病毒Delt a株S基因Δ156 ‑157突说　明　书 1/5 页 3 CN 114561496 B 3