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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210441411.9 (22)申请日 2022.04.25 (71)申请人 武汉轻工大 学 地址 430023 湖北省武汉市东西湖区常青 花园学府南路68号 (72)发明人 李龙杰 吴钰周 邓玉凯 肖先金  颜贝 曾永辉  (74)专利代理 机构 北京金智普华知识产权代理 有限公司 1 1401 专利代理师 张晓博 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种荧光探针、 检测方法及应用 (57)摘要 本发明属于荧光探针检测技术领域, 公开了 一种荧光探针、 检测方法及应用, 构建调控DNA链 置换反应的新型元件DNA楔形元件; 基于楔形元 件的调控特性, 对基因突变检测方法进行改进, 设计一种“信号抑制型 ”的基因突变检测新方法; wtDNA触发的荧光信号被完全互补配对的楔形元 件猝灭, 而与楔形元件有一个碱基错配的mtDNA 所触发的荧光信号则不受影响。 本发明的 “信号 抑制型”探针从原理上对传统方法进行优化改 进, 使检测体系中荧光的产生对突变位点的位置 和类型无选择性, 因而可对未知突变进行检测, 且优化成本低, 实现较高通量的突变检测, 减轻 社会与患者的经济负担 。 权利要求书2页 说明书9页 序列表2页 附图4页 CN 114959027 A 2022.08.30 CN 114959027 A 1.一种荧光探针检测方法, 其特征在于, 所述荧光探针检测方法包括: 构建调控DNA链 置换反应的新型元件DNA楔形元件; 基于楔形元件的调控 特性, 对基因突变检测方法进 行改 进, 获取信号抑制型的基因, 用于突变检测; wtDNA触发的荧光信号被完全互补配对的楔形 元件猝灭, 与楔形 元件碱基错配的mtDNA 始终触发荧 光信号。 2.如权利要求1所述 荧光探针检测方法, 其特 征在于, 所述楔形 元件的构建方法包括: 采用包含辅助序列的链置换序列通用结构, 在链置换过程中添加一个新的独立调节元 件; 所述辅助序列用于为楔 形元件提供 空间平台; 所述楔形元件由结构域I和结构域T组成, 所述结构域I被设计成与入侵链的辅助序列结构域或辅助域互补, 所述结构域T被 设计成与 模板链的辅助域互补; 楔形 元件与入侵链和模板链杂交后, 形成楔形三联体。 3.如权利要求1所述型荧光探针检测方法, 其特征在于, 所述型荧光探针检测方法还包 括: 通过改变I ‑T和T‑I之间两个结构域的位置连接顺序实现双向调节; 当结构域 I和结构域T分别与入侵链和底 物链结合后, 形成楔形的夹角。 4.如权利要求1所述荧光探针检测方法, 其特征在于, 所述型荧光探针检测方法包括以 下步骤: 步骤一, 序列设计: 设计并合成野生型PTEN基因wtDNA、 突变型PTEN基因mtDNA、 模板链、 目标链以及N W; 步骤二, 向EP管中加入10 ×ThermoPol缓冲液, 再加入目标链、 模板链和去离子水, 在 金 属浴中按照已设定的程序加热和退火混合物; 步骤三, 将退火后的混合物加入酶标条中, 加入NW、 入侵链和去离子水, 用离心机将溶 液全部离心到底部, 置 于酶标仪中检测荧 光强度。 5.如权利要求4所述荧光探针检测方法, 其特征在于, 所述步骤一中的wtDNA的核苷酸 序列为SEQ  ID NO: 1, 所述mtDNA的核苷酸序列为SEQ  ID NO: 2, 所述模板链的核苷酸序列为 SEQ ID NO: 3, 所述目标链的核苷酸序列为SEQ  ID NO: 4, 所述NW的核苷酸序列为SEQ  ID  NO: 5。 6.如权利要求4所述型荧光探针检测方法, 其特征在于, 所述步骤二中的10 × ThermoPol 缓冲液的加入量为4.8 μL, 所述目标链的终浓度为250nM, 所述模板链的终浓度为 250nM, 用去离子水使总体积达到46μL; 所述已设定的程序为: 85℃1min, 55℃1min, 37℃ 5min。 7.如权利要求4所述 “turn‑on”型荧光探针检测方法, 其特征在于, 所述步骤三中的退 火后的混合物为46 μL, 所述NW的终浓度为500nM, 所述入侵链的终浓度为250nM, 用去离子水 将总体积补足到 50 μL, 最终的摩尔比为: 模板链: 入侵链: 目标链: 楔形 元件=1.0 5: 1: 1: 1; 所述离心条件为: 3500rpm, 室温, 1.5min, 置于酶标仪中检测37℃温度下的荧光强度; 所述荧光记录的激发/发射波长为485nm/525nm, 荧光强度每45s测量一次, 总检测时间为 3600s或5400s。 8.一种应用如权利要求1~7任意 一项所述的荧 光探针检测方法的荧 光探针。 9.一种荧光探针检测试剂盒, 其特征在于, 所述荧光探针检测试剂盒包括应用 如权利 要求1~7任意一项所述的荧光探针检测方法中核苷酸序列为SEQ  ID NO: 1~核苷酸序列 SEQ ID NO: 5。权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 114959027 A 210.一种如权利要求1~7任意一项所述的荧光探针检测方法在未知基因突变检测中的 应用。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 114959027 A 3

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