(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210425374.2 (22)申请日 2022.04.22 (71)申请人 中国农业科 学院棉花研究所 地址 455000 河南省安阳市开发区黄河大 道38号 申请人 山东省农业 技术推广中心 （山 东省 农业农村发展研究中心） (72)发明人 赵云雷　王红梅　王桂峰　陈伟　 魏学文　邢晓飞　芦建华　赵佩　 桑晓慧　张杰　秦都林　 (74)专利代理 机构 北京天奇智新知识产权代理 有限公司 1 1340 专利代理师 于益 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01)C12N 15/11(2006.01) A01H 1/04(2006.01) (54)发明名称 棉花抗黄萎病主效QTL位点紧密连锁的KASP 引物和应用 (57)摘要 本发明公开了一种棉花抗黄萎病主效QTL位 点紧密连锁的KASP引物和应用， 所述KASP引物序 列如SEQ ID NO： 265‑282所示； 抗黄萎病主效QTL 位点分别为qVW ‑D05‑1、 qVW‑D05‑2、 qVW‑D05‑3和 qVW‑A01‑1。 本发明进行了 单个抗黄萎病主效QTL 的分子标记辅助筛选， 筛选得到了抗病纯合等位 基因型的材料和感病纯合等位基因型的材料； 进 行了多个抗黄萎病主效QTL的分子聚合筛选， 筛 选得到了聚合多个抗黄萎病主效QTL位点的材 料。 权利要求书2页 说明书11页 序列表44页 附图6页 CN 114891912 A 2022.08.12 CN 114891912 A 1.一种棉花抗黄萎病主效QTL位点 紧密连锁的KASP引物， 其特征在于： 所述KASP引物序 列如SEQ ID NO： 265‑282所示； 其中， KASP ‑Z407标记的等位基 因特异引物如SEQ  ID NO： 265‑266所示， 公共引物如SEQ   ID NO： 267所示； KASP‑Z367标记的等位基因特异引物如SEQ  ID NO： 268‑269所示， 公共引物如SEQ  ID  NO： 270所示； KASP‑Z324标记的等位基因特异引物如SEQ  ID NO： 271‑272所示， 公共引物如SEQ  ID  NO： 273所示； KASP‑Z427标记的等位基因特异引物如SEQ  ID NO： 274‑275所示， 公共引物如SEQ  ID  NO： 276所示； KASP‑Z005标记的等位基因特异引物如SEQ  ID NO： 277‑278所示， 公共引物如SEQ  ID  NO： 279所示； KASP‑Z428标记的等位基因特异引物如SEQ  ID NO： 280‑281所示， 公共引物如SEQ  ID  NO： 282所示。 2.根据权利要求1所述的棉花抗黄萎病主效QTL位点紧密连锁的KASP引物， 其特征在 于： 抗黄萎病主效QTL 位点分别为qVW ‑D05‑1、 qVW‑D05‑2、 qVW‑D05‑3和qVW‑A01‑1； 其中， qVW ‑D05‑1的连锁群为LG_D05.1， 位置为53.7998cM， 2LOD置信区间为KASP ‑Z367‑ KASP‑Z407‑SWU18948， 0.51c M， 72,511bp； qVW‑D05‑2的连锁群为LG_D05.2， 位置为4.0000cM， 2LOD置信区间为GH265 ‑SWU17703 ‑ SWU17712， 1.51c M， 239,195bp； qVW‑D05‑3的连锁群为LG_D05.2， 位置为2.0000cM， 2LOD置信区间为SWU17713 ‑KASP‑ Z324‑DPL0063， 1.01cM， 122,962bp； qVW‑A01‑1的连锁群为LG_A01.1， 位置为5.2cM， 2LOD置信区间为KASP ‑Z427‑KASP‑ Z005‑KASP‑Z428， 0.51c M， 14,954bp。 3.根据权利要求2所述的棉花抗黄萎病主效QTL位点紧密连锁的KASP引物， 其特征在 于： KASP ‑Z367标记的连锁位置为53.5400cM， 物理位置为62,509,658bp， QTL间距为 0.2598cM； KASP‑Z407标记的连锁位置为53.7900cM， 物理位置为62,575,437bp， QTL间距为 0.0098cM； KASP‑Z324标记的连锁位置为2.0 3cM， 物理位置为2,434,594bp， QTL间距为0.0 3cM； KASP‑Z427标记的连锁位置为 4.76cM， 物理位置为1 16,707,120bp， QTL间距为0.4 4cM； KASP‑Z005标记的连锁位置为5.27c M， 物理位置为1 16,722,074bp， QTL间距为0.07c M； KASP‑Z428标记的连锁位置为5.27c M， 物理位置为1 16,718,0 68bp， QTL间距为0.07c M。 4.权利要求1 ‑3任一所述的棉花抗黄萎病主效QTL位点 紧密连锁的KASP引物的应用， 其 特征在于： 进 行单个抗黄萎病主效QTL的分子标记辅助筛选， 筛选抗病纯合等位基因型的材 料和感病纯合 等位基因型的材 料。 5.权利要求1 ‑3任一所述的棉花抗黄萎病主效QTL位点 紧密连锁的KASP引物的应用， 其 特征在于： 进行多个抗黄萎病主效QTL的分子聚合筛选， 筛选聚合多个抗黄萎病主效QTL位 点的材料。权　利　要　求　书 1/2 页 2 CN 114891912 A 26.权利要求1 ‑3任一所述的棉花抗黄萎病主效QTL位点 紧密连锁的KASP引物的应用， 其 特征在于： 对感黄 萎病的棉花品种进行抗黄 萎病性状的快速分子改良。 7.权利要求1 ‑3任一所述的棉花抗黄萎病主效QTL位点 紧密连锁的KASP引物的应用， 其 特征在于： 筛选得到含有抗黄萎病QTL的抗病自交系RIL ‑2、 RIL‑5、 RIL‑8、 RIL‑10、 RIL‑12、 RIL‑13、 RIL‑14、 RIL‑19、 RIL‑31、 RIL‑32、 RIL‑68、 RIL‑69、 RIL‑78、 RIL‑82、 RIL‑89、 RIL‑90、 RIL‑92、 RIL‑96、 RIL‑97、 RIL‑109、 RIL‑114、 RIL‑125、 RIL‑131、 RIL‑132、 RIL‑143、 RIL‑133、 RIL‑150、 RIL‑218。权　利　要　求　书 2/2 页 3 CN 114891912 A 3