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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210399331.1 (22)申请日 2022.04.15 (71)申请人 江苏省淡水 水产研究所 地址 210017 江苏省南京市 茶亭东街79号 (72)发明人 钟立强 王明华 陈校辉 张世勇  姜虎成  (74)专利代理 机构 江苏德善律师事务所 3248 8 专利代理师 赵鹏 (51)Int.Cl. C12N 15/11(2006.01) C12Q 1/6888(2018.01) C12Q 1/6869(2018.01) (54)发明名称 一种分子鉴别斑点叉尾鮰和云斑鮰的引物 及方法 (57)摘要 本发明提供一种分子鉴别斑点叉尾鮰和云 斑鮰的引物及方法, 引物的核苷酸序列如SEQ   NO:1和SEQ  NO:2或SEQ NO:3和SEQ  NO:4所示。 本 发明从细胞色素氧化酶亚基I基因、 细胞色素b基 因进行斑点叉尾鮰等相似鱼类的鉴定, 利用上述 引物通过线粒体基因组DNA条形码技术能够快速 便捷准确可靠地鉴别这两种鱼类, 该引物及方法 能够快速便捷准确可靠地对斑点叉尾鮰、 云斑鮰 等进行鉴别, 结果稳定性好, 重复率高, 填补了目 前国内分子生物学标准鉴别斑点叉尾鮰和云斑 鮰和黄颡鱼的空白, 将在生态资源调查和鱼类品 种鉴定中发挥重要作用, 具有广泛的应用前 景。 权利要求书1页 说明书5页 附图1页 CN 114836414 A 2022.08.02 CN 114836414 A 1.一种分子鉴别斑点叉尾鮰和云斑鮰的引物,其特征在于: 引物的核苷酸序列如SEQ   NO:1和SEQ  NO:2或SEQ  NO:3和SEQ  NO:4所示。 2.如权利要求1所述的分子鉴别斑点叉尾鮰和云斑鮰的引物,其特征在于: 所述SEQ   NO:1和SEQ NO:2用于鉴别斑点叉尾鮰、 云斑鮰和黄颡鱼; 所述SEQ  NO:3和SEQ  NO:4用于鉴 别斑点叉尾鮰 和云斑鮰。 3.用权利要求1所述的引物进行分子鉴别的方法,其特 征在于: 包括以下内容, (1) 分别提取待鉴定的斑点叉尾鮰和云斑鮰、 黄颡鱼基因组DNA, 以提取的基因组DNA为 模板, 用引物SEQ  NO:1和SEQ  NO:2进行PCR扩增, 扩增产物纯化后测序, 对斑点叉尾鮰、 云斑 鮰和黄颡鱼扩增产物序列比对, 细胞色素氧化酶亚基I基因序列的第325 ‑339位点碱基为 (CTC)3(CTG)2重复序列, 编码氨基酸为LLLLL的是云斑鮰, 碱基为TTC(CTG)2(CTA)2重复序 列, 编码氨基酸为FLLLL的是黄颡鱼, 碱基为TTCCTACTTCTGCTC序列, 编码氨基酸为FLLLL的 是斑点叉尾鮰; 或者, (2) 分别提取待鉴定的斑点叉尾鮰和云斑鮰基因组DNA, 以提取的基因组DNA为模 板, 用引物SEQ  NO:3和SEQ  NO:4进行PCR扩增, 扩增产物纯化后测序, 对斑点叉尾鮰和云斑 鮰扩增产物序列比对, 细胞色素b基因序列的第562 ‑573位点碱基 为(ATC)2(GCA)2重复序列, 编码氨基酸为IIAA的是斑点叉尾鮰; 碱基为(GTT)2GCGGCA重复序列, 编码氨基酸为VVAA的 是云斑鮰。 4.根据权利要求3所述的方法, 其特征在于: 所述的PCR反应体系为50  mL: 50ng/μL的 模板DNA 1 mL, PCR缓冲液  5 mL, dNTP混合液4  mL , 每种dNTP  0.1mmol/L,  10 μmol/L的 上、 下游引物各 1 mL, 2mL 2 IU 的Taq酶; 双蒸水36mL; 所述的PCR缓冲液由10mmol/L  Tris‑ HCl, pH9.0,  0.5mmol/L KCl, 30mmol/L MgCl2, 0.01%明胶组成。 5.根据权利要求3所述的方法, 其特征在于: 方法 (1) 中, PCR扩增 反应程序为: 94  ℃预 变性2 min, 94 ℃变性45  s, 55℃退火1  min, 72 ℃延伸1 min, 经30个循环后再72  ℃延伸 10 min。 6.根据权利要求3所述的方法, 其特征在于: 方法 (2) 中, PCR扩增 反应程序为: 94  ℃预 变性2 min, 94 ℃变性45  s, 60℃退火1  min, 72 ℃延伸1 min, 经30个循环后再72  ℃延伸 10 min。 7.一种用于斑点叉尾鮰和云斑鮰的鉴别试剂 盒, 其特征在于, 所述试剂 盒包含引物SEQ   ID NO:1—SEQ  ID NO:4中的一种或几种。 8.根据权利要求7 所述的试剂盒, 其特 征在于: 所述试剂盒还 包括PCR扩增试剂。 9.氨基酸序列FL LLL在鉴别斑点叉尾鮰 和黄颡鱼中的应用。 10.根据权利要求9所述的应用, 其特征在于: 氨基酸序列FLLLL对应于细胞色素氧化酶 亚基I基因序列的第325 ‑339位点, 当碱基为TTC(CTG)2(CTA)2重复序列, 是黄颡鱼, 碱基为 TTCCTACTTCTGCTC序列, 是斑点叉尾鮰。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114836414 A 2一种分子鉴别斑点叉尾鮰和云斑鮰的引物及方 法 技术领域 [0001]本发明属于分子生物学技术领域, 具体涉及一种分子鉴别斑点叉尾鮰和云斑鮰的 引物及方法。 背景技术 [0002]斑点叉尾鮰  (Ictalures  punctatus )和云斑鮰( Ameiurus  nebulosus )都产于北 美, 是大型的鲇形目鱼类, 上世纪80年引先后入我国试养, 相继突破了养殖、 繁殖、 饲料、 加 工出口等环 节技术难关, 产量和养殖面积不断扩大, 成为我国主 要的鲇形目养殖鱼类之一。 [0003]斑点叉尾鮰和云斑鮰都是无鳞的鲇形目鱼类, 形态较为相似, 栖息水域也相同, 尤 其是幼鱼阶段, 仅通过形态和颜色难以鉴别, 做成鱼类制品后更是难以准确 鉴定。 此外, 斑 点叉尾鮰和云斑鮰的广泛养殖, 造成了一定的逃逸, 对我国水域生态和本土鱼类造成了一 定的破坏。 作为重要的出口特色鱼类, 斑点叉尾鮰和云斑鮰是我国主要 出口美国的品种, 美 国监管部门要求出口鱼类制品准确标注物种名称, 这也对两种鱼类的准确鉴别提出了严格 要求。 因此, 亟 待一种快捷方便、 准确可靠的鉴别斑点叉尾鮰 和云斑鮰的方法。 发明内容 [0004]为了克服现有技术中存在的不足, 本发明提供一种分子鉴别斑点叉尾鮰和云斑鮰 的引物及方法。 [0005]为实现上述目的, 本 发明提供一种分子鉴别斑点叉尾鮰和云斑鮰的引物,其中: 引 物的核苷酸序列如SEQ  NO:1和SEQ  NO:2或SEQ  NO:3和SEQ  NO:4所示。 [0006]优选的, 所述SEQ  NO:1和SEQ  NO:2用于鉴别斑点叉尾鮰、 云斑鮰和黄颡鱼; 所述 SEQ NO:3和SEQ  NO:4用于鉴别斑点叉尾鮰 和云斑鮰。 [0007]作为本发明的另一方面, 本发明提供一种进行分子鉴别的方法,其特征在于: 包括 以下内容, (1) 分别提取待鉴定的斑点叉尾鮰和云斑鮰、 黄颡鱼基因组DNA, 以提取的基因组 DNA为模板, 用引物SEQ  NO:1和SEQ  NO:2进行PCR扩增, 扩增产物纯化后测序, 对斑点叉尾 鮰、 云斑鮰和 黄颡鱼扩增产物序列比对, 细胞色素氧化酶亚基I基因序列的第325 ‑339位点 碱基为(CTC)3(CTG)2重复序列, 编码氨基酸为LLLLL的是云斑鮰, 碱基为TTC(CT G)2(CTA)2重 复序列, 编码氨基酸为FLLLL的是黄颡鱼, 碱基为TTCCTACTTCTGCTC序列, 编码氨基酸为 FLLLL的是斑点叉尾鮰; 或者, (2) 分别提取待鉴定的斑点叉尾鮰和云斑鮰基因组D NA, 以提取的基因组D NA 为模板, 用引物SEQ  NO:3和SEQ  NO:4进行PCR扩增, 扩增产物纯化后测序, 对斑点叉尾鮰和 云斑鮰扩增产物序列比对, 细胞色素b基因序列的第 562‑573位点碱基为(ATC)2(GCA)2重复 序列, 编码氨基酸为IIAA的是斑点叉尾鮰; 碱基为(GTT)2GCGGCA重复序列, 编码氨基酸为 VVAA的是云斑鮰。 [0008]优选的, 所述的PCR反应体系为50  mL: 50ng/μL的模板DNA  1 mL, PCR缓冲液  5 说 明 书 1/5 页 3 CN 114836414 A 3

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