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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210399766.6 (22)申请日 2022.04.15 (71)申请人 重庆市农业科 学院 地址 401329 重庆市九龙坡区白市驿镇农 科大道 (72)发明人 陶涛 王永清 邹敏 杨洋  田时炳 周珊珊 胡玮  (74)专利代理 机构 北京东方盛凡知识产权代理 事务所(普通 合伙) 11562 专利代理师 王颖 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种区分茄子果肉颜色的DNA分子标记及应 用 (57)摘要 本发明公开了一种区分茄子果肉颜色的DNA 分子标记及应用, 属于分子生物学领域。 所述DNA 分子标记为茄子基因第8号染色体80586213到 80589660碱基位, 核苷酸序列如SEQ  ID NO: 21所 示。 还公开了扩增所述的DNA分子标记的引物对, 以及该分子标记或引物对在在茄子果肉颜色选 育中的应用。 通过试验验证发现, 本发明公开的 DNA分子标记可以将绿肉和白肉类型的材料区分 开来, 提高茄子 育种效率。 权利要求书1页 说明书9页 序列表9页 附图12页 CN 114574624 A 2022.06.03 CN 114574624 A 1.一种区分茄子果肉颜色的DNA分子标记, 其特征在于, 其为茄子基因第8号染色体 80586213到80589660碱基位, 核苷酸序列如SEQ  ID NO: 21所示。 2.扩增权利要求1中所述的DNA分子标记的引物对。 3.如权利要求2所述的引物对, 其特 征在于, 所述引物对 包括如下 所示任一对: ep7‑17F: ATGAAAACTCCACTCTACTCTACTC CAC; ep7‑17R: GTTTGCTAACGTACGC CTCAATTGCTCT; 0802018‑3F: AACTTACAGAAATCCCACATTGAGG; 0802018‑4R: CCGCGCTACACT TTCTTCCT; 0802018‑6R: CCATGTAATTGCAGTTTACTCGTTC; SSR9F: CTCTGTCAT TGTCACAT TAGG; SSR9R: ATG GTCGAATTGGCAAGAA; SSR90F: TTCTGGTTGTTCTCTTCGAT; SSR90R: TGAG GTAATGGTAAGGTCTAC; SSR‑133F: GGAGAAACAACCATCTATTC; SSR‑133R: CAACGAATTGGTGACAGT; SSR‑165F: CATCG GAGCATCACTGT T; SSR‑165R: GACCAAAGTCAAAGCAAGTT; SSR‑377F: CATGTCATCGAG GTATCATT; SSR‑377R: GCTCACACACT TGAAAGG; SSR‑852F: CAGT TGCCTGCTTAATTGTC; SSR‑852R: CGAT TGACGTGTCTGCT TA。 4.一种区分茄子果肉颜色的试剂盒, 其特征在于, 包括权利要求1所述的DNA分子标记 或权利要求2 ‑3任一项所述的引物对。 5.一种如权利 要求1所述的DNA分子标记, 或权利要求2 ‑3任一项所述的引物对, 或权利 要求4所述的试剂盒在茄子果肉颜色选 育中的应用。 6.一种利用权利要求1所述的DNA分子标记检测茄子果肉基因的方法, 其特征在于, 包 括以下步骤: (1)利用权利要求2或3所述的引物对 扩增待检测茄子果肉DNA; (2)如果扩增产物显示222bp的条带, 为白色果肉; 扩增产物仅显示199bp条带, 为绿色 果肉; 扩增产物显示2 22bp和199bp两条带时, 为绿色果肉。 7.如权利要求6所述的方法, 其特征在于, 扩增反应体系为: ddH2O 4.7 μL, 2×Mix 5 μL, F 引物和R引物各0.1 μL, 模板DNA  0.1 μL。 8.如权利要求6所述的方法, 其特征在于, 扩增程序为: 95℃预变性5min; 95℃变性 30sec、 55℃退火3 0sec、 72℃延伸1mi n, 35个循环; 反应结束后, 72℃再延伸2mi n; 4℃保存。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114574624 A 2一种区分茄子果 肉颜色的DNA分子标记及应用 技术领域 [0001]本发明涉及分子生物学领域, 特别是涉及一种区分茄子果肉颜色的DNA分子标记 及应用。 背景技术 [0002]茄子(Solanum  melongena  L.)原产于印度、 东南亚热带地区, 于公元4 ‑5世纪传入 国内, 中国被认为是茄子的第二起源地。 在中国, 茄子果实形态演化出圆球、 卵圆、 长筒、 长 条、 短羊角等11种类型, 果色也演化出白、 绿、 紫红、 黑紫等8种颜色。 茄子在中 国各地广泛栽 培, 是人们喜爱 的一种重要果菜。 根据2016年联合 国粮食及农业组织(FAO)统计显示, 中国 是茄子栽培面积最大的国家, 播种面积78.19万公顷, 占世界茄子产业的43.59%。 长期以 来, 由于中国各区域多样化的气候生态类型以及差异化的消费习惯, 各区域形成了独特 的 茄子栽培品种类型, 不同区域生产和消费的茄子品种在果形、 果色、 果 肉色、 果肉软硬程度 等性状方面存在巨大差异。 茄子栽培种果肉颜色有白、 黄白、 绿白、 绿等, 果肉色差异的主要 原因是叶绿素有 无或在果 实发育过程中叶绿素积累或降解程度。 有关茄子果皮颜色的遗传 和分子标记研究相对较多, 而有关茄子果 肉色的遗传研究相对较少 。 有关与果肉相关的分 子标记还未 见报道。 发明内容 [0003]本发明的目的是提供一种区分茄子果肉颜色的DNA分子标记及应用, 以解决上述 现有技术存在的问题, 该分子标记可以将绿肉和白肉类型 的材料区分开来, 提高茄子育种 效率。 [0004]为实现上述目的, 本发明提供了如下 方案: [0005]本发明提供一种区分茄子果肉颜色的DNA分子标记, 其为茄子基因第8号染色体 80586213到80589660碱基位, 具体核苷酸序列如SEQ  ID NO: 21所示(该分子标记的基因序 列见http://eggplant‑hq.cn/Eggplant/home/index)。 [0006]本发明还提供了扩增所述的DNA分子标记的引物对。 [0007]优选的是, 所述引物对 包括如下 所示任一对: [0008]ep7‑17F(SEQ ID NO: 1): ATGA AAACTCCACTCTACTCTACTC CAC; [0009]ep7‑17R(SEQ ID NO: 2): GT TTGCTAACGTACGC CTCAATTGCTCT; [0010]0802018‑3F(SEQ ID NO: 3): AACTTACAGAAATCCCACATTGAGG; [0011]0802018‑4R(SEQ ID NO: 4): CCGCGCTACACT TTCTTCCT; [0012]0802018‑6R(SEQ ID NO: 5): CCATGTAATTGCAGTTTACTCGTTC; [0013]SSR9F(SEQ ID NO: 6): CTCTGTCAT TGTCACAT TAGG; [0014]SSR9R(SEQ ID NO: 7): ATG GTCGAATTGGCAAGAA; [0015]SSR90F(SEQ  ID NO: 8): TTCTGGTTGTTCTCTTCGAT; [0016]SSR90R(SEQ  ID NO: 9): TGAG GTAATGGTAAGGTCTAC;说 明 书 1/9 页 3 CN 114574624 A 3

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