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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210359991.7 (22)申请日 2022.04.07 (66)本国优先权数据 202111197436.0 2021.10.14 CN (71)申请人 湖南农业大 学 地址 410000 湖南省长 沙市农大路1号 (72)发明人 刘志 陈俊华 潘家峰 王伟平  邓芳 袁小玲  (74)专利代理 机构 长沙和雅知识产权代理事务 所(普通合伙) 43238 专利代理师 林传贵 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/682(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种检测水稻OsNramp5基因的方法及试剂 盒 (57)摘要 本发明属于分析检测技术领域, 具体涉及一 种荧光鉴定水稻镉低吸收基因OsNramp5的方法 及检测试剂盒。 本发明提供一种荧光鉴定水稻镉 低吸收基因OsNramp5的方法及检测试剂盒, 检测 试剂盒包括H1核酸发夹结构、 H2核酸发夹结构、 H3核酸发夹结构、 H4核酸发夹结构和缓冲液。 基 于DNAzyme催化的和催化发夹自组装(CHA)的放 大技术, 建立一种无酶的OsNramp5生物传感器。 本发明的方法具有良好的稳定性, 简单、 灵活的 设计且灵敏度高等独特优势, 易于大规模推广使 用。 权利要求书1页 说明书5页 序列表2页 附图2页 CN 114959092 A 2022.08.30 CN 114959092 A 1.一种检测水稻OsNramp5基因的试剂盒, 其特征在于, 所述检测试剂盒包括H1核酸发 夹结构、 H2核酸发夹结构、 H 3核酸发夹结构、 H4核酸发夹结构和缓冲液。 2.根据权利要求1所述的试剂盒, 其特征在于, 所述H1核酸发夹结构包含OsNramp5识别 区域和Cd2+依赖性DNAzyme酶链。 3.根据权利要求2所述的试剂盒, 其特征在于, 所述H1核酸发夹结构的核苷酸序列如 SEQ ID NO:1所示。 4.根据权利要求1所述的试剂盒, 其特征在于, 所述H2核酸发夹结构包含Cd2+依赖性 DNAzyme底 物链。 5.根据权利要求4所述的试剂盒, 其特征在于, 所述H2核酸发夹结构的核苷酸序列如 SEQ ID NO:2所示。 6.根据权利要求1所述的试剂盒, 其特征在于, 所述H3核酸发夹结构的核苷酸序列如 SEQ ID NO:3所示。 7.根据权利要求1所述的试剂盒, 其特征在于, 所述H3核酸发夹结构的两侧连接荧光基 团和荧光猝灭基团。 8.根据权利要求6所述的试剂盒, 其特征在于, 所述荧光基团为Cy5; 所述荧光猝灭基团 为BHQ2。 9.根据权利要求8所述的试剂盒, 其特征在于, 所述H4核酸发夹结构与H3核酸发夹结构 的核酸序列碱基部分互补, H4核酸发夹结构的核苷酸序列如SEQ  ID NO:4所示。 10.根据权利要求1 ‑9任一所述的试剂盒, 其特 征在于, 所述缓冲液包括M ES缓冲液。 11.根据权利要求10所述的试剂盒, 其特征在于, 所述MES缓冲液包含25mM  NaCl, 1μM   Cd2+, pH=6.0 。 12.一种利用权利要求1 ‑11任一所述的试剂盒来鉴定水稻OsNramp5基因的方法, 其特 征在于, 包括下列步骤: (1)H1、 H2、 H3、 H4核酸发夹结构的形成: H1、 H2、 H3和H4核酸发夹结构分别在缓冲液中加 热到95℃  5min, 并冷却到室温; (2)OsNramp5基因的检测: 将200nM  H1核酸发夹结构、 600nM  H2核酸发夹结构与待测液 在25℃存在1 μM  Cd2+的条件下孵育30分钟; 将600 nM H3核酸发夹结构和1200nM  H4核酸发夹 结构加入到上述溶液中, 室温孵育60min, 在590 ‑750nm范围内观察到荧光光谱, 从而达到检 测OsNramp5基因的目的。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114959092 A 2一种检测水稻OsNr amp5基因的方 法及试剂盒 技术领域 [0001]本发明属于分析检测技术领域, 具体涉及一种检测水稻OsNramp5基因的方法及试 剂盒。 背景技术 [0002]镉是一种剧毒重金属, 可导致与镉相关的疾病。 稻米作为我国重要的主食, 对镉具 有较高的吸收效率, 易导致膳食中镉摄入量过高, 对人类健康构成严重威胁, 而且稻田环 境 中高浓度的镉还会影响水稻的正常生长发育。 因此, 迫切需要选育镉低吸收的水稻品种, 以 降低潜在的健康风险, 保障食品安全。 [0003]近年来, 越来越多的研究表明OsNramp5基因(OsN)是水稻中控制镉等重金属吸收 的一个关键基因, 该基因的缺失能显著减少根系对镉的吸收, 降低稻米中镉的含量。 目前, 已报道有关OsNramp5基因检测的方法, 如一种与水稻镉低吸收基因OsNramp5相关的SNP位 点及其应用(申请号20201161599 0.1)和用于检测水稻OsNRAMP5基因的特异InDel分子标记 引物及其应用(申请号202010239340.5)都采用PCR扩增检测, 需要DNA聚合酶、 费时、 成本较 高和存在假阳性等。 本发明利用该基因作为反向分子生物标志物, 建立一种无酶的   OsNramp5生物传感器, 并开发简单、 快速、 低成本的镉低吸收基因鉴定与试剂盒, 从而对镉 低吸收水稻种质资源材料的鉴定、 品种选育和保障稻米品质安全以及育种平台部署等方面 具有重要意 义。 发明内容 [0004]本发明所要解决的技术问题是, 克服以上背景技术中提到 的不足和缺陷, 提供一 种荧光鉴定水稻镉低吸收基因OsNramp5的方法及检测试剂盒。 基于DNAzyme催化的和催化 发夹自组装(CHA)的放大技术, 建立一种无酶的OsNramp5生物传感器。 所述方法具有良好的 稳定性, 简单、 灵活的设计且灵敏度高等独特优势, 易于大规模推广使用。 [0005]本发明所采取的技 术方案是: [0006]一种荧光鉴定水稻镉低吸收基因OsNramp 5的检测试剂盒, 所述检测试剂盒包括H 1 核酸发夹结构、 H2核酸发夹结构、 H 3核酸发夹结构、 H4核酸发夹结构和缓冲液。 [0007]优选地, H1核酸发夹结构包 含OsNramp5识别区域和Cd2+依赖性DNAzyme酶链。 [0008]优选地, H1核酸发夹结构的核苷酸序列如SEQ  ID NO:1所示。 [0009]优选地, H2核酸发夹结构包 含Cd2+依赖性DNAzyme底 物链。 [0010]优选地, H2核酸发夹结构的核苷酸序列如SEQ  ID NO:2所示。 [0011]优选地, H 3核酸发夹结构的核苷酸序列如SEQ  ID NO:3所示。 [0012]优选地, H 3核酸发夹结构的两侧连接荧 光基团和荧 光猝灭基团。 [0013]优选地, 荧 光基团为Cy5; 所述 荧光猝灭基团为BHQ2。 [0014]优选地, H4核酸发夹结构与H3核酸发夹结构的核酸序列碱基部分互补, H4核酸发 夹结构的核苷酸序列如SEQ  ID NO:4所示。说 明 书 1/5 页 3 CN 114959092 A 3

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