(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210321711.3 (22)申请日 2022.03.30 (66)本国优先权数据 202111449060.8 2021.1 1.30 CN (71)申请人 江苏鹍远生物技 术有限公司 地址 225129 江苏省扬州市邗江区创富路1 号创富工场6号楼 申请人 上海鹍远生物科技股份有限公司 (72)发明人 王辉　苏志熙　杨其昌　刘轶颖　 周爽　马成城　刘蕊　 (74)专利代理 机构 上海巅石知识产权代理事务 所(普通合伙) 31309 专利代理师 张琤　孙宋暄 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01)C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一组肿瘤检测标志 物及其用途 (57)摘要 本申请涉及一组肿瘤检测标志物及其用途， 具体涉及一种确认肝肿瘤的存在、 评估肝肿瘤形 成或形成风险和/或评估肝肿瘤的进展的方法， 包含评估待测样本中一组标志物基因所在DNA区 域或其片段的修饰状态的存在和/或含量。 本申 请还涉及用于评估一组DNA区域修饰状态的核 酸、 核酸组和/或试剂盒， 及其制备方法。 权利要求书1页 说明书31页 序列表13页 CN 114574584 A 2022.06.03 CN 114574584 A 1.一种确认肝肿瘤的存在、 评估肝肿瘤形成或形成风险和/或评估肝肿瘤的进展的方 法和/或评估肝肿瘤相关DNA区域甲基化状态的方法， 包含确定待测样本中目标基因所在 DNA区域或其片段的修饰 状态的存在和/或含量， 所述目标基因包 含SEPT9和IKZF1。 2.如权利要求1所述的方法， 所述目标基因还包含选自以下组的基因： BEST4、 B4GALNT1、 GRAS P、 IRF4和BEND4。 3.一种确 认疾病的存在、 评估疾病形成或形成风险和/或评估疾病的进展的方法和/或 确定DNA区域甲基化状态的方法， 包含确定待测样 本中目标DNA区域、 或其互补区域、 或上述 的片段的修饰状态的存在和/或含量， 所述目标DNA区域包含来源于人chr17:75368651 ‑ 75370720和来源于人c hr7:50343720‑50344547定义的区域。 4.如权利要求3所述的方法， 所述目标DNA区域还包含选自以下组定义的区域： 来源于 人chr1:45251728 ‑45252477、 来源于人chr12:58020498 ‑58022962、 来源于人chr12: 52400724 ‑52401698、 来源于人chr6:391739 ‑394056、 和来源于人chr4:42152705 ‑ 42154895 。 5.一种核酸， 所述核酸包含能够结合如权利要求1 ‑2中任一项所述的方法中所述目标 基因所在DNA区域、 或其互补区域、 或上述的转化而来的区域、 或上述的片段的序列； 或者所 述核酸包含能够结合如权利要求3 ‑4中任一项所述的方法中所述目标DNA区域、 或其互补区 域、 或上述的转 化而来的区域、 或上述的片段的序列。 6.一种核酸组， 所述核酸组包含能够结合如权利要求1 ‑2中任一项所述的方法中所述 目标基因所在DNA区域、 或其互补区域、 或上述的转化而来的区域、 或上述的片段的序列； 或 者所述核酸组包含能够结合如权利要求3 ‑4中任一项 所述的方法中所述目标DNA区域、 或其 互补区域、 或上述的转 化而来的区域、 或上述的片段的序列。 7.一种试剂盒， 包 含如权利要求5所述的核酸和/或权利要求6所述的核酸组。 8.如权利要求5所述的核酸、 如权利要求6所述的核酸组和/或权利要求7所述的试剂 盒， 在制备疾病检测产品和/或确认疾病的存在、 评估疾病形成或形成风险和/或评估疾病 的进展的物质中的应用。 9.用于确定DNA区域修饰状态 的核酸、 核酸组和/或试剂盒， 在制备用于确认肝肿瘤的 存在、 评估肝肿瘤形成或形成风险和/或评估肝肿瘤的进展的物质中的应用， 所述用于确定 的DNA区域包含如权利要求1 ‑2中任一项所述的方法中所述目标基因所在DNA区域或其片 段。 10.用于确定DNA区域修饰状态的核酸、 核酸组和/或试剂 盒， 在制备用于确认疾病的存 在、 评估疾病形成或形成风险和/或评估疾病的进展的物质中的应用， 所述用于确定的DNA 区域包含如权利要求3 ‑4中任一项所述的方法中所述目标DNA区域、 或其互补区域、 或上述 的片段。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114574584 A 2一组肿瘤检测标志物及其用途 技术领域 [0001]本申请涉及生物医药 领域， 具体的涉及一组肿瘤检测标志 物及其用途。 背景技术 [0002]寻找更高效的肿瘤标志物一直是肿瘤相关研究中重要的一个方向， 基于液体 活检 的血浆游离DNA检测技术对于肿瘤标志物的发现有了更高的需求。 其基本原理为： 肿瘤细胞 死亡后， 释放游离DNA进入 血液， 通过检测血液中的DNA突变、 DNA甲基化、 miRNA、 组蛋白修饰 等肿瘤细胞相关信息， 可探测到 极早期的肿瘤信号。 已有研究发现DNA甲基化变化可能早于 DNA突变的发生， 是肿瘤早期筛查的更 行之有效的检测标志 物。 [0003]但目前早期癌症中， 释放入血的肿瘤细胞极少， 并且本领域急需寻找到更多的对 于肝肿瘤有效的检测标志物。 因此， 亟需开发一种方法和/或试剂盒， 通过检测准确、 稳定、 有效的肝癌生物标志物或其组合， 且可以从生物样品中数量极为有限的细胞外游离DNA高 效地读取到该表观遗传学信息， 更优的， 该方法应可以在医院检验科里很容易地配置并可 靠地应用。 发明内容 [0004]本申请提供的方法可以将更多高效的甲基化标志物， 用于确认或辅助确认疾病的 存在、 评估疾病形成或形成风险和/或评估疾病的进展， 可以提高肿瘤， 例如肝肿瘤的早筛 早诊效率， 解决肝癌早诊率低、 临床治疗负担 重等问题。 [0005]一方面， 本申请提供了一种确认肝肿瘤的存在、 评估肝肿瘤形成或形成风险和/或 评估肝肿瘤的进展的方法， 包含确定待测样本中目标基因所在DNA区域或其片段的修饰状 态的存在和/或含量， 所述目标基因包 含SEPT9和IKZF1。 [0006]另一方面， 本申请还提供了一种评估肝肿瘤相关D NA区域甲基化状态的方法， 包含 确定待测样本中目标基因所在DNA区域 或其片段的修饰状态的存在和/或含量， 所述目标基 因包含SEPT9和IKZF1。 [0007]另一方面， 本申请还提供了一种确认疾病的存在、 评估疾病形成或形成风险和/或 评估疾病的进展的方法， 包含确定待测样本中目标DNA区域、 或其互补区域、 或上述的片段 的修饰状态的存在和/或含量， 所述目标DNA区域包含来源于人chr17:75368651 ‑75370720 和来源于人c hr7:50343720‑50344547定义的区域。 [0008]另一方面， 本申请还提供了一种确定DNA区域甲基化状态的方法， 包含确定待测样 本中目标DNA区域、 或其互补区域、 或上述的片段的修饰状态的存在和/或含量， 所述目标 DNA区域包含来源于人chr17:75368651 ‑75370720和来源于人chr7:50343720 ‑50344547定 义的区域。 [0009]另一方面， 本申请还提供了一种核酸， 所述核酸包含能够结合如本申请的方法中 所述目标基因所在DNA区域、 或其互补区域、 或上述的转化而来的区域、 或上述的片段的序 列； 或者所述核酸包含能够结合如本申请的方法中所述目标DNA区域、 或其互补区域、 或上说　明　书 1/31 页 3 CN 114574584 A 3