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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210128468.3 (22)申请日 2022.03.29 (71)申请人 复旦大学附属妇产科医院 地址 200011 上海市黄浦区方斜路419号 申请人 厦门飞朔生物技 术有限公司 (72)发明人 陈婷婷 刘天齐 陈志宏 陈琰  周先荣  (74)专利代理 机构 北京鑫瑞森知识产权代理有 限公司 1 1961 专利代理师 王立普 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) C12Q 1/6869(2018.01) C40B 50/06(2006.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种基于高通量测序子宫内膜癌分子分型 的文库构建方法 (57)摘要 本发明公开了一种基于高通量测序子宫内 膜癌分子分型的文库 构建方法, 属于生物技术领 域。 本发明基于多重PCR的扩增子靶向高通量测 序, 同时对11个基因突变和10个微卫星 位点检测 微卫星不稳定状态进行检测, 根据检测结果评估 内膜癌患者分子特征。 本发明最低能稳定检出 5ng/μL样本中2%突变比例和肿瘤含 量为5%的 微卫星不稳定状态, 分型结果准确性更高; 本发 明检测的基因数目更多, 可获得更多的肿瘤突变 信息; 本发明文库构建过程仅需3~5小时, 操作 简便、 成本低廉; 本发明仅通过一次检测即可完 成子宫内膜癌的分子分型。 本发 明更适合临床应 用, 能更好地辅助医生评估患者预后、 调整临床 治疗方案, 还能满足遗传性子宫内膜癌的筛查 等。 权利要求书2页 说明书41页 序列表125页 附图4页 CN 114438210 A 2022.05.06 CN 114438210 A 1.一种基于高通量测序的子宫内膜癌分子分型的引物, 其特征在于, 包括特异修饰性 扩增引物和接头扩增引物, 所述特异修饰性扩增引物的序列如SEQ  ID NO.1~SEQ  ID  NO.788所示, 所述接 头扩增引物的序列如SEQ  ID NO.789~SEQ ID NO.790所示。 2.一种基于高通量测序的子宫内膜癌分子分型的试剂盒, 其特征在于, 包含如权利要 求1所述的引物。 3.一种基于高通量测序子宫内膜癌分子分型的文库构建方法, 其特征在于, 包括如下 步骤: (1)使用所述特异修饰性扩增引物对待测样本进行超多重PCR富 集反应; (2)富集产物纯化; (3)接头连接所述接 头扩增引物进行PCR反应获得文库; (4)文库的纯化。 4.根据权利要求3所述的文库构建方法, 其特征在于, 所述步骤(1)中的待测样本为手 术切除的新鲜病理组织, 甲醛固定石蜡包埋病例组织, 石蜡切片, 全血, 血浆, 血清, 胸腔积 液中的一种。 5.根据权利 要求3所述的文库构建方法, 其特征在于, 所述步骤(1)中的PCR扩增程序如 下表所示: 6.根据权利 要求3所述的文库构建方法, 其特征在于, 所述步骤(1)中的PCR扩增反应体 系包括EC‑1体系和E C‑2体系; 所述EC‑1体系如下表所示: 所述EC‑2体系如下表所示:权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 114438210 A 27.根据权利 要求3所述的文库构建方法, 其特征在于, 所述步骤(3)中PCR扩增程序如下 表所示: 8.根据权利 要求3所述的文库构建方法, 其特征在于, 所述步骤(3)中PCR扩增反应体系 如下表所示: 序号 物料 物料浓度 用量( μL) 1 RingCapbuf fer 10× 2.5 2 MgCl225mM 4 3 dNTPs 10 μM 1 4 Ill‑iXX‑P7(SEQ ID NO.790) 50 μM 0.2 5 Ill‑iXX‑P5(SEQ ID NO.789) 50 μM 0.2 6 H2O 纯化水 11.85 7 RingCap‑Taq酶 5U/ul 0.25 8 富集PCR纯化产物 ‑ 5 总体积 25 9.根据权利要求3 ‑8中任一项所述的文库构建方法, 其特征在于, 所述文库构建方法实 现的是对11个基因MSH2、 PMS2、 MLH1、 MSH6、 EPCAM、 POLE、 TP53、 PTEN、 PIK3CA、 KRAS和CTNNB1 突变和对10个微 卫星位点检测微 卫星不稳定状态的检测。 10.根据权利要求3 ‑9中任一项所述的文库构建方法所构建的测序文库。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 114438210 A 3

PDF文档 专利 一种基于高通量测序子宫内膜癌分子分型的文库构建方法

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