(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210320291.7 (22)申请日 2022.03.29 (71)申请人 广东海洋大学 地址 524088 广东省湛江市麻章区海大路1 号 (72)发明人 杨转英　王廷芹　丰锋　王俊宁　 徐光照　李国鹏　王佳卉　 (74)专利代理 机构 北京金智普华知识产权代理 有限公司 1 1401 专利代理师 张晓博 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/29(2006.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种早期鉴别红橙变异植株的分子标记及 其应用 (57)摘要 本申请公开了一种早期鉴别红橙变异植株 的分子标记及其应用， 所述分子标记为甜橙 Cs3g14240基因， 位于三号染色体第18641380 ‑ 18646722之间。 通过所述 分子标记可以达到早期 鉴定红橙橙型红肉果和其他变异 株型， 可在细胞 水平上可以鉴定红橙和变异果， 该鉴定方法简 单、 快速， 准确， 对红橙苗育种及针对变异 株型进 行早期干预有积极作用。 权利要求书1页 说明书4页 序列表2页 附图2页 CN 114736984 A 2022.07.12 CN 114736984 A 1.一种早期鉴别红橙变异植株的分子标记， 其特征在于， 所述分子标记为甜橙 Cs3g14240基因， 位于三号染色体第18641380 ‑18646722之间， 其核苷酸序列如SEQ  ID NO:1 所示。 2.一组用于扩增权利要求1所述分子标记SEQ  ID NO:1序列的引物对， 其序列如下： P1： 如SEQ ID NO:2所示； P2： 如SEQ ID NO:3所示。 3.一种早期鉴别红橙变异植株的方法， 其特征在于， 包括以下步骤： 提取早期红橙苗待 检样品总RNA； 以mRNA为模板， 逆转录成cDNA； 以权利要求2所述引物对 对cDNA进行PCR扩增， 获得PCR产物； 对PCR产物进行分析， 鉴定早期红橙变异植株 类型， 筛选出橙型红肉果类型的植株； 培育筛选的红肉果类型植株， 进行培 育， 并对筛 选的结果进行验证。 4.权利要求1所述分子标记的筛 选方法， 其特 征在于， 包括以下步骤： 对红橙橙型红肉果、 橙型黄肉果和 橘变果三个样品组进行转录组分析； 通过韦恩图分析， 找出橙型红肉果、 橙型黄肉果和橘变果三个样品组中共有或独有的 差异基因； 筛选差异基因， 并对差异基因进行表达分析， 在橙型红肉果表达量最大的差异基因即 为权利要求1所述分子标记。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114736984 A 2一种早期鉴别红橙变异植株的分子标记及其应用 技术领域 [0001]本申请涉及 植物分子鉴定技术领域， 尤其涉及一种早期鉴别红橙变异植株的分子 标记及其应用。 背景技术 [0002]红橙， 是芸香科柑橘属下甜橙的一个栽培品种植物， 原由廉江市内的红江农场培 育成功。 红橙是一个变异单株， 是甜橙和红桔的嫁接嵌合体， 属嫁接嵌合体变异。 红橙在生 长发育过中会出现橙型的红肉果、 黄肉果、 红黄肉嵌合果以及桔 型的桔变果、 嵌合桔变果等 5种变异果实， 极少情况下五种果 实会在同一植株上同时出现， 更多的是同一植株结一种或 两种类型果实。 五种果实中， 橙型红肉果为商品果， 其品质优、 数量多、 商品性好， 为红橙的 代表类型， 而其 他四种均为非商品果。 [0003]因此， 如何早期对红橙苗进行鉴定并筛选出橙型红肉果类型植株进行培育是本领 域亟待解决的问题。 发明内容 [0004]有鉴于此， 本申请的目的在于提供一种早期鉴别红橙变异植株的分子标记及 其应 用， 以在一定程度上解决上述 技术问题之一。 [0005]第一方面， 本申请实施例公开了一种早期鉴别红橙变异植株的分子标记， 所述分 子标记为甜橙Cs3g14240基因， 位于三号染色体第18641380 ‑18646722之间， 其核苷酸序列 如SEQ ID NO:1所示。 [0006]第二方面， 本申请实施例提供了一组用于扩增第一方面分子标记SEQ  ID NO:1序 列的引物对， 其序列如下： [0007]P1： 如SEQ ID NO:2所示； [0008]P2:SEQ ID NO:3所示。 [0009]第三方面， 本申请实施例提供了一种早期鉴别红橙变异植株的方法， 包括以下步 骤： [0010]提取早期红橙 苗待检样品总RNA； [0011]以mRNA为模板， 逆转录成cDNA； [0012]以第二方面所述引物对 对cDNA进行PCR扩增， 获得PCR产物； [0013]对PCR产物进行分析， 从而鉴定早期红橙变异植株类型， 筛选出橙型红肉果类型的 植株； [0014]培育筛选的红肉果类型植株， 进行培 育， 并对筛 选的结果进行验证。 [0015]第四方面， 本申请实施例提供了第一方面所述分子标记的筛选方法， 包括以下步 骤： [0016]对红橙橙型红肉果、 橙型黄肉果和 橘变果三个样品组进行转录组分析； [0017]通过韦恩图分析， 找出橙型红肉果、 橙型黄肉果和橘变果三个样品组中共有或独说　明　书 1/4 页 3 CN 114736984 A 3