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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210289507.8 (22)申请日 2022.03.23 (71)申请人 深圳大学总医院 地址 518000 广东省深圳市南 山区桃源街 道大学城学苑大道1098号 (72)发明人 龚勋 李晓武 刘玉琛  (74)专利代理 机构 深圳市深弘广联知识产权代 理事务所(普通 合伙) 44449 专利代理师 向用秀 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) C12Q 1/686(2018.01) C12N 15/11(2006.01) G16B 25/10(2019.01) (54)发明名称 检测胰腺癌预后情况的试剂盒 (57)摘要 发明公开了一种检测胰腺癌预后情况的试 剂盒, 试剂盒中包含有miRNA的上下游引物序列、 U6的上下游引物序列和辅助组分, miRNA包括有 miRNA934,miRNA4444 ‑2,miRNA3655,miRNA1301 分子中的一条或多条, 通过试剂盒与经过处理后 的胰腺癌患者预后的离体样本中的miRNA进行检 测, 获得miRNA组合在样本中的表达, 根据表达量 高低的组分来确定患者胰腺癌预后情况, 本发明 通过对患者样本中特异性表达的4个miRNA的表 达情况进行了检测, 并建立区分胰腺癌患者预后 不良的诊断试剂盒, 可以全面提高对胰腺癌预后 疗效及转移、 复发预测的准确度。 权利要求书1页 说明书5页 附图2页 CN 114438217 A 2022.05.06 CN 114438217 A 1.一种检测胰腺癌预后情况的试剂盒, 其特征在于, 试剂盒中包含有miRNA的上下游引 物序列、 U6的上下游引物序列和辅助组分, miRNA包括有miRNA934,miRNA4444 ‑2, miRNA3655,miRNA1301分子中的一条或多条, 通过试剂盒与经过处理后的胰腺癌患者预后 的离体样本中的miRNA进行检测, 获得miRNA组合在样本中的表达, 根据表达量高低的组分 来确定患者胰腺癌预后情况。 2.根据权利要求1所述的检测胰腺癌预后情况的试剂 盒, 其特征在于, 对胰腺癌患 者预 后的样本处 理过程如下: S1:测定离体样本中异常表达的miRNA 表达水平; S2: 比较被测定离体样本中与参考样本与配对 的正常胰腺组织中miRNA分子是否存在 差异表达, 表达 差异与胰腺癌 患者预后复发或转移是否具有相关性。 3.根据权利要求2所述的检测胰腺癌预后情况的试剂 盒, 其特征在于, 离体样本包括胰 腺癌组织样本、 血 液、 血浆中的一种或多种。 4.根据权利要求2所述的检测胰腺癌预后情况的试剂盒, 其特征在于, 在步骤S2中, 差 异表达的为患者的临床病例特征, 其中临床病例特征包括患者性别、 年龄、 肿瘤部位、 肿瘤 直径、 组织分化 程度、 肿瘤浸润深度、 淋巴结转移、 远处转移、 TNM分期及5年存活率。 5.根据权利要求1所述的检测胰腺癌预后情况的试剂盒, 其特征在于, 辅助组分包括 RNA提取系统、 逆转录试剂及PCR扩增试剂。 6.根据权利要求5所述的检测胰腺癌预后情况的试剂盒, 其特征在于, RNA提取系统包 括裂解液、 RNA吸附柱和RNA漂洗液; 逆转录试剂为反应混合液、 逆转录酶和超纯 水。 7.根据权利要求1所述的检测胰腺癌预后情况的试剂 盒, 其特征在于, 试剂 盒中还含有 胰腺癌组织样本提取的总RNA混合后, 逆转录并稀释的cDNA。 8.根据权利要求1所述的检测胰腺癌预后情况的试剂盒, 其特征在于, miRNA的识别过 程如下: A1: 在癌症基因 组图谱中下 载胰腺癌的miRNA和mRNA和临床数据; A2:利用R软件中的DESeq2筛 选出mRNA差异 表达基因, 并将根据差异基因作热图; A3:利用G O注释和KEG G途径对差异 表达基因进行分析, 筛 选出miRNA的差异基因; A4: 利用3个R包miRNAtap, multiMiR和hoardeR找到差异miRNA的靶基 因, 并且根据该靶 基因进行G O注释和KEG G途径进行分析。 A5: 利用DEmiRNA的靶基因和差异基因建立miRNA ‑mRNA共表达网络; 并且在共表达网络 中的差异基因做GO ‑KEGG功能富集分析; DEmiRNA做生存曲线分析, 从而得到转移性和非转 移性胰腺癌样品中表达mRNA和miRNA。 9.根据权利要求8所述的检测胰腺癌预后情况的试剂盒, 其特征在于, 在步骤A5后, 利 用Lasso回归模型针对miRNA构建比例风险回归模型, 根据最后剩余的miRNA的组合从而判 断胰腺癌预后危险因素 是否会发生。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114438217 A 2检测胰腺癌预后情况的试剂盒 技术领域 [0001]本发明涉及生物医药 领域, 尤其涉及一种检测胰腺癌预后情况的试剂盒。 背景技术 [0002]胰腺癌(PAAD)是总体肿瘤类型中最致命的癌症之一。 由于PAAD发病隐匿、 异质性 强, 在早期不易发现, 仅在疾病晚期出现, 导致5年生存率极低, 仅为~10%。 有机会接受手 术切除的患者比例不到20%。 此外, 接受完全肿瘤切除的PAAD患者通常会在2 年内出现局部 或远处复发。 因此, PA AD治疗仍然是一个重大挑战, [0003]PAAD的不良预后可能是由于其侵袭转移、 对治疗产生耐药, 缺乏早期筛查标志物 和诊断方法所致。 传统的预后预测方法是基于患者年龄、 一般健康状况、 合并症和耐受治疗 的能力, 还包括组织学分级、 淋巴结或远处转移、 血管和血管周围浸润和 CA199等临床病例 特征。 然而, 由于PAAD的肿瘤异质性和恶性程度之高, 迄今为止几乎没有临床益处。 因此, 仍 然急需更好的方法对胰腺癌患者 五年复发转移 风险以及辅助化疗获益进 行预测, 使部 分早 期胰腺癌患者, 避免痛苦的化疗。 随着非编码RNA作为肿瘤标志物的出现, 提示在肿瘤发生 发展过程中, microRNA比受体、 蛋白等出现得 更早, 而这对肿瘤的诊断尤为重要。 [0004]随着新一代测序技术的快速发展技术, 大多数人类癌症现在已经全面分析, 这导 致了对以前未知的分子亚型的识别, 从而改善了预后、 诊断和肿瘤精准医疗。 尽管从生物学 的角度来看分子亚型很有趣, 但由于每个亚型都有数百个基因特征, 并且针对预后不良的 亚型引入了各种分子亚型分类标准, 但对每个患者进行转录组分析 的难度, 其转化为临床 实践一直具有挑战性。 已有大量研究证明, microRNA(miRNA)表达在恶性肿瘤中经常失调, 单个miRNA可以调节数十种靶基因的表达, 新出现的证据突出了miRNA作为癌症生物标志物 的潜力, 且mi RNA是比其他已知生物标志物更好的生物标志物, 在临床前研究中显示出治疗 疾病的有益效果。 综合起来, 一组预后miRNA可能为PAAD患者分层和分子 分型提供更强大且 具有临床意 义的特征。 发明内容 [0005]针对上述技术中存在的不足之处, 本发明提供一种检测胰腺癌预后情况的试剂 盒, 通过对患者样本中特异性表达的4个miRNA的表达情况进行了检测, 并建立区分胰腺癌 患者预后不良的诊断试剂盒, 可以全面 提高对胰腺癌预后疗效及转移、 复发预测的准确度。 [0006]为实现上述目的, 本发明提供一种检测胰腺癌预后情况的试剂盒, 试剂盒中包含 有miRNA的上下游引物序列、 U6的上下游引物序列和辅助组分, miRNA包括有miRNA934, miRNA4444 ‑2,miRNA3655,miRNA1301分子 中的一条或多条, 通过试剂盒与 经过处理后的胰 腺癌患者预后的离体样本中的miRNA进行检测, 获得miRNA组合在样本中的表达, 根据表达 量高低的组分来确定患者胰腺癌预后情况。 [0007]作为优选, 对 胰腺癌患者预后的样本处 理过程如下: [0008]S1:测定离体样本中异常表达的miRNA 表达水平;说 明 书 1/5 页 3 CN 114438217 A 3

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