(19)国家知识产权局
(12)发明 专利申请
(10)申请公布号
(43)申请公布日
(21)申请 号 202210289507.8
(22)申请日 2022.03.23
(71)申请人 深圳大学总医院
地址 518000 广东省深圳市南 山区桃源街
道大学城学苑大道1098号
(72)发明人 龚勋 李晓武 刘玉琛
(74)专利代理 机构 深圳市深弘广联知识产权代
理事务所(普通 合伙) 44449
专利代理师 向用秀
(51)Int.Cl.
C12Q 1/6886(2018.01)
C12Q 1/686(2018.01)
C12N 15/11(2006.01)
G16B 25/10(2019.01)
(54)发明名称
检测胰腺癌预后情况的试剂盒
(57)摘要
发明公开了一种检测胰腺癌预后情况的试
剂盒, 试剂盒中包含有miRNA的上下游引物序列、
U6的上下游引物序列和辅助组分, miRNA包括有
miRNA934,miRNA4444 ‑2,miRNA3655,miRNA1301
分子中的一条或多条, 通过试剂盒与经过处理后
的胰腺癌患者预后的离体样本中的miRNA进行检
测, 获得miRNA组合在样本中的表达, 根据表达量
高低的组分来确定患者胰腺癌预后情况, 本发明
通过对患者样本中特异性表达的4个miRNA的表
达情况进行了检测, 并建立区分胰腺癌患者预后
不良的诊断试剂盒, 可以全面提高对胰腺癌预后
疗效及转移、 复发预测的准确度。
权利要求书1页 说明书5页 附图2页
CN 114438217 A
2022.05.06
CN 114438217 A
1.一种检测胰腺癌预后情况的试剂盒, 其特征在于, 试剂盒中包含有miRNA的上下游引
物序列、 U6的上下游引物序列和辅助组分, miRNA包括有miRNA934,miRNA4444 ‑2,
miRNA3655,miRNA1301分子中的一条或多条, 通过试剂盒与经过处理后的胰腺癌患者预后
的离体样本中的miRNA进行检测, 获得miRNA组合在样本中的表达, 根据表达量高低的组分
来确定患者胰腺癌预后情况。
2.根据权利要求1所述的检测胰腺癌预后情况的试剂 盒, 其特征在于, 对胰腺癌患 者预
后的样本处 理过程如下:
S1:测定离体样本中异常表达的miRNA 表达水平;
S2: 比较被测定离体样本中与参考样本与配对 的正常胰腺组织中miRNA分子是否存在
差异表达, 表达 差异与胰腺癌 患者预后复发或转移是否具有相关性。
3.根据权利要求2所述的检测胰腺癌预后情况的试剂 盒, 其特征在于, 离体样本包括胰
腺癌组织样本、 血 液、 血浆中的一种或多种。
4.根据权利要求2所述的检测胰腺癌预后情况的试剂盒, 其特征在于, 在步骤S2中, 差
异表达的为患者的临床病例特征, 其中临床病例特征包括患者性别、 年龄、 肿瘤部位、 肿瘤
直径、 组织分化 程度、 肿瘤浸润深度、 淋巴结转移、 远处转移、 TNM分期及5年存活率。
5.根据权利要求1所述的检测胰腺癌预后情况的试剂盒, 其特征在于, 辅助组分包括
RNA提取系统、 逆转录试剂及PCR扩增试剂。
6.根据权利要求5所述的检测胰腺癌预后情况的试剂盒, 其特征在于, RNA提取系统包
括裂解液、 RNA吸附柱和RNA漂洗液; 逆转录试剂为反应混合液、 逆转录酶和超纯 水。
7.根据权利要求1所述的检测胰腺癌预后情况的试剂 盒, 其特征在于, 试剂 盒中还含有
胰腺癌组织样本提取的总RNA混合后, 逆转录并稀释的cDNA。
8.根据权利要求1所述的检测胰腺癌预后情况的试剂盒, 其特征在于, miRNA的识别过
程如下:
A1: 在癌症基因 组图谱中下 载胰腺癌的miRNA和mRNA和临床数据;
A2:利用R软件中的DESeq2筛 选出mRNA差异 表达基因, 并将根据差异基因作热图;
A3:利用G O注释和KEG G途径对差异 表达基因进行分析, 筛 选出miRNA的差异基因;
A4: 利用3个R包miRNAtap, multiMiR和hoardeR找到差异miRNA的靶基 因, 并且根据该靶
基因进行G O注释和KEG G途径进行分析。
A5: 利用DEmiRNA的靶基因和差异基因建立miRNA ‑mRNA共表达网络; 并且在共表达网络
中的差异基因做GO ‑KEGG功能富集分析; DEmiRNA做生存曲线分析, 从而得到转移性和非转
移性胰腺癌样品中表达mRNA和miRNA。
9.根据权利要求8所述的检测胰腺癌预后情况的试剂盒, 其特征在于, 在步骤A5后, 利
用Lasso回归模型针对miRNA构建比例风险回归模型, 根据最后剩余的miRNA的组合从而判
断胰腺癌预后危险因素 是否会发生。权 利 要 求 书 1/1 页
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2检测胰腺癌预后情况的试剂盒
技术领域
[0001]本发明涉及生物医药 领域, 尤其涉及一种检测胰腺癌预后情况的试剂盒。
背景技术
[0002]胰腺癌(PAAD)是总体肿瘤类型中最致命的癌症之一。 由于PAAD发病隐匿、 异质性
强, 在早期不易发现, 仅在疾病晚期出现, 导致5年生存率极低, 仅为~10%。 有机会接受手
术切除的患者比例不到20%。 此外, 接受完全肿瘤切除的PAAD患者通常会在2 年内出现局部
或远处复发。 因此, PA AD治疗仍然是一个重大挑战,
[0003]PAAD的不良预后可能是由于其侵袭转移、 对治疗产生耐药, 缺乏早期筛查标志物
和诊断方法所致。 传统的预后预测方法是基于患者年龄、 一般健康状况、 合并症和耐受治疗
的能力, 还包括组织学分级、 淋巴结或远处转移、 血管和血管周围浸润和 CA199等临床病例
特征。 然而, 由于PAAD的肿瘤异质性和恶性程度之高, 迄今为止几乎没有临床益处。 因此, 仍
然急需更好的方法对胰腺癌患者 五年复发转移 风险以及辅助化疗获益进 行预测, 使部 分早
期胰腺癌患者, 避免痛苦的化疗。 随着非编码RNA作为肿瘤标志物的出现, 提示在肿瘤发生
发展过程中, microRNA比受体、 蛋白等出现得 更早, 而这对肿瘤的诊断尤为重要。
[0004]随着新一代测序技术的快速发展技术, 大多数人类癌症现在已经全面分析, 这导
致了对以前未知的分子亚型的识别, 从而改善了预后、 诊断和肿瘤精准医疗。 尽管从生物学
的角度来看分子亚型很有趣, 但由于每个亚型都有数百个基因特征, 并且针对预后不良的
亚型引入了各种分子亚型分类标准, 但对每个患者进行转录组分析 的难度, 其转化为临床
实践一直具有挑战性。 已有大量研究证明, microRNA(miRNA)表达在恶性肿瘤中经常失调,
单个miRNA可以调节数十种靶基因的表达, 新出现的证据突出了miRNA作为癌症生物标志物
的潜力, 且mi RNA是比其他已知生物标志物更好的生物标志物, 在临床前研究中显示出治疗
疾病的有益效果。 综合起来, 一组预后miRNA可能为PAAD患者分层和分子 分型提供更强大且
具有临床意 义的特征。
发明内容
[0005]针对上述技术中存在的不足之处, 本发明提供一种检测胰腺癌预后情况的试剂
盒, 通过对患者样本中特异性表达的4个miRNA的表达情况进行了检测, 并建立区分胰腺癌
患者预后不良的诊断试剂盒, 可以全面 提高对胰腺癌预后疗效及转移、 复发预测的准确度。
[0006]为实现上述目的, 本发明提供一种检测胰腺癌预后情况的试剂盒, 试剂盒中包含
有miRNA的上下游引物序列、 U6的上下游引物序列和辅助组分, miRNA包括有miRNA934,
miRNA4444 ‑2,miRNA3655,miRNA1301分子 中的一条或多条, 通过试剂盒与 经过处理后的胰
腺癌患者预后的离体样本中的miRNA进行检测, 获得miRNA组合在样本中的表达, 根据表达
量高低的组分来确定患者胰腺癌预后情况。
[0007]作为优选, 对 胰腺癌患者预后的样本处 理过程如下:
[0008]S1:测定离体样本中异常表达的miRNA 表达水平;说 明 书 1/5 页
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专利 检测胰腺癌预后情况的试剂盒
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