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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210287763.3 (22)申请日 2022.03.22 (71)申请人 广西扬翔股份有限公司 地址 537000 广西壮 族自治区贵港市江南 工业园区城东大道与工业一路交汇处 东北角 申请人 广西贵港秀博基因科技股份有限公 司 (72)发明人 赵云翔 郑伟杰 周玉 李斌  朱琳 夏攀洁 袁仁强  (74)专利代理 机构 广州文智专利代理事务所 (特殊普通 合伙) 44469 专利代理师 梁媛 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01)C12N 15/11(2006.01) A01K 67/02(2006.01) (54)发明名称 与猪达115公斤体重背膘厚相关的SNP分子 标记及其应用 (57)摘要 本发明公开了一种 与猪达115公斤体重背膘 厚相关的SNP分子标记, 该分子标记位于国际猪 基因组Ensembl  Sscrofa 11.1版本18号染色体 第10718753bp位置处的G/A碱基突变或位于SEQ   ID NO.1所示的核苷酸序列中第61位碱基M, 所述 M选自碱基G或A的SNP分子标记; 该分子 标记能早 期、 快速、 低成本、 有效的预测猪背膘厚度, 在猪 种改良方面具有广阔的应用前景, 并能够取得优 异的经济价 值。 权利要求书1页 说明书5页 序列表1页 附图2页 CN 114752678 A 2022.07.15 CN 114752678 A 1.与猪达115公斤体重背膘厚相关的SNP 分子标记, 其中, 所述SNP 分子标记位于国际猪 基因组Ensembl  Sscrofa 11.1版本18号染色体第1071875 3bp位置处的G/A碱基突变。 2.根据权利要求1所述的SNP分子标记, 其中, 所述SNP分子标记位于SEQ  ID NO.1所示 的核苷酸序列中第61位碱基M, 所述M 选自碱基G或A。 3.权利要求1或2所述的SNP分子标记在瘦肉型猪选 育上的应用。 4.根据权利要求3所述的应用, 其中, 所述应用的方法包括: 1)对猪仔检测如权利要求1或2所述的分子标记; 2)选留步骤1)中检测得到的等位基因型为GG基因型的个体, 进行繁育, 即可得到瘦肉 型猪。 5.权利要求1或2所述的SNP分子标记在培 育瘦肉型猪品系上的应用。 6.根据权利要求5所述的应用, 其中, 所述应用的方法包括: 1)对待留种的备选种猪 检测如权利要求1或2所述的分子标记; 2)选留步骤1)中检测得到的等 位基因型为G G基因型的个 体; 3)将步骤2)选留的个 体作为种猪 配种, 进行繁 育, 培育出高瘦肉型的猪品系。 7.权利要求1或2所述的SNP分子标记在瘦肉型猪遗传改良上的应用。 8.根据权利要求7 所述的应用, 其中, 所述应用的方法包括: 1)对待留种的备选种猪 检测如权利要求1或2所述的分子标记; 2)选留步骤1)检测得到的等 位基因型为G G基因型的个 体; 3)将步骤2)选留的个体作 为种猪配种, 后代继续选留GG基因型猪, 淘汰其他基因型猪, 以逐代提高G G优势等位基因型的频率, 从而改良和提高后代猪的瘦肉率。 9.权利要求1或2所述的SNP分子标记在育肥 型猪选育上的应用。 10.根据权利要求9所述的应用, 其中, 所述应用的方法包括: 1)对猪仔检测如权利要求1或2所述的分子标记; 2)选留步骤1)中检测得到的等位基因型为AA基因型的个体, 进行繁育, 即可得到育肥 型猪。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114752678 A 2与猪达115公斤体重背膘 厚相关的SNP分子标记及其应用 技术领域 [0001]本发明涉及分子遗产学领域, 特别涉及一种与猪达 115公斤体重背膘厚相关的SNP 分子标记及其应用。 背景技术 [0002]我国是一个养猪大国和猪肉消费大国, 猪肉消费量常年居于肉制品之首。 市场对 于猪肉产量和质量的需求日益增加, 提高猪肉产量、 改善猪肉胴体质量, 是育种科学家长期 以来不断探索的工作。 早期的育种工作主要 是基于猪的表型进 行选择, 可靠性低, 导致遗传 进展相对缓慢。 随着遗传标记的广泛开发和育种新技术的不断推陈出新。 分子标记辅助选 择育种, 是在分子水平上对目标性状进行选择, 可以不受环境影响, 通过遗传背景选择, 减 少连锁累赘, 从而加速育种过程及精 准度。 因此, 分子标记辅助选择正逐渐成为可靠而有效 的选择方法。 [0003]分子标记(Molecular  Markers), 指可遗传并可检测的DNA序列。 目前, 广泛应用的 第三代分子标记 为单核苷 酸多态性(SNP), SNP是指基因组上单个核苷 酸的变异, 包括转换、 颠换、 插入和缺失。 SNP在基因组上分布广泛, 数量多, 遗传稳定性高, 更适合用于对复杂性 状与疾病的遗传解剖以及基于群体的基因识别等方面的研究。 同时, 由于SNP具有二态性, 且单个SNP位点突变率低, 易于通过芯片技术 实现自动化和规模化检测。 因此, SNP广泛应用 于基因组分析、 生物信息自动化检测、 简单和复杂疾病的遗传研究、 畜牧育种标记及 全球种 族遗传学等研究。 [0004]猪的背膘厚表示脂肪多少, 背膘厚度越厚瘦肉率越低, 相反, 则瘦肉率高。 由于背 膘厚与猪产肉性能有强相关性, 因此, 研 究猪的达115公斤体重背膘厚(BF), 在育种中具有 重要的研究意义。 利用基因芯片检测技术对猪群体进行GWAS研究, 有助于快速筛选到影响 猪达115公斤体重背膘厚的有意 义的分子标记, 为猪的标记辅助选择育种提供有利的工具。 发明内容 [0005]本发明的目的是提供一种与猪达115公斤体重背膘厚相关的SNP分子标记及其应 用, 为猪的标记辅助选择育种提供有利的工具。 [0006]根据本发明的一个方面, 提供了与猪达115公斤体重背膘厚相关的SNP分子标记, 该分子标记位于国际猪基因组Ensembl  Sscrofa 11.1版本18  号染色体第107 18753bp位置 处的G/A碱基突变。 [0007]在某些实施方式中, 该SNP分子标记位于SEQ  ID NO.1所示的核苷酸序列中第6 1位 碱基M, 所述M 选自碱基G或A。 [0008]本发明的第二个方面, 提供了一种位于国际猪基因组Ensembl  Sscrofa 11.1版本 18号染色体第107 18753bp位置处的G/A碱基突变的SNP分子标记或位于SEQ  ID NO.1所示的 核苷酸序列中第61位碱基M, 所述M 选自碱基G或A的SNP分子标记在瘦肉型猪选 育上的应用。 [0009]在某些实施方式 中, 上述SNP分子标记在瘦肉型猪选 育上的应用方法包括:说 明 书 1/5 页 3 CN 114752678 A 3

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