(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210264089.7 (22)申请日 2022.03.17 (71)申请人 承德市农林科 学院 地址 067055 河北省承 德市双桥区冯营子 镇 申请人 天津科润农业科技股份有限公司 　 天津市农业科 学院 (72)发明人 董岩　牛国保　陶秀娟　乔军　 闫丽　姚星伟　孙德岭　崔轶男　 郭久林　范庆杰　韩建国　 (74)专利代理 机构 天津市鼎拓知识产权代理有 限公司 12 233 专利代理师 朱丽丽 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01)C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 与黄色菜花颜色相关的分子标记及其应用 (57)摘要 本发明公开了一种与黄色菜花颜色相关的 分子标记， 所述分子标记的序列如SEQ  ID NO:1 所示， 其中， 在所述SEQ  ID NO:1第102bp处发生 Ins/Del突变， 第102bp处碱基为Ins  TGAGACACT 时菜花颜色为黄色； 如SEQ  ID NO:2所示， 其中， 在所述SEQ  ID NO:2第151bp处发生C/T突变， 第 151bp处碱基为CC时菜花颜色为黄色。 可在幼苗 阶段对菜花颜色进行准确预测， KASP基因分型技 术可以大批量检测应用， 有助于提高黄色菜花品 种的鉴定效率， 缩短鉴定时间。 权利要求书1页 说明书17页 序列表2页 附图3页 CN 114736980 A 2022.07.12 CN 114736980 A 1.与黄色菜花颜色相关的分子标记， 其特征在于， 所述分子标记的序列如SEQ  ID NO:1 所示， 其中， 在所述SEQ  ID NO:1第102bp处发生Ins/Del突变， 第102bp处碱基为Ins   TGAGACACT时菜花颜色为黄色； 如SEQ ID NO:2所示， 其中， 在所述SEQ  ID NO:2第151bp处发生C/T突变， 第151bp处碱 基为CC时菜花颜色为黄色。 2.根据权利 要求1所述的分子标记的KASP引物， 其特征在于， 所述KASP引物包括上游引 物1、 上游引物2以及下游引物， 其中， SEQ  ID NO:1上游引物1的序列如SEQ  ID NO:3所示， 上 游引物2的序列如SEQ  ID NO:4所示， 下游引物的序列如SEQ  ID NO:5所示。 3.根据权利要求2所述的KASP引物， 其特征在于， SEQ  ID NO:2上游引物1的序列如SEQ   ID NO:6所示， 上游引物 2的序列如SEQ  ID NO:7所示， 下游引物的序列如SEQ  ID NO:8所示。 4.根据权利 要求2所述的KASP引物， 其特征在于， 所述KASP引物在鉴定与菜花叶片颜色 相关的SNP多态性及基因型产品中的应用。 5.一种与黄色菜花颜色相关的分子标记的应用， 其特 征在于， 在菜花育种中的应用。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114736980 A 2与黄色菜花颜色相关的分子标记及其应用 技术领域 [0001]本发明涉及 生物分子检测及育种领域， 具体涉及与黄色菜花颜色相关的分子标记 及其应用。 背景技术 [0002]菜花， 又称花菜、 花椰菜或椰菜花， 是一种美味且富含营养的常见蔬菜。 菜花叶片 颜色不同， 呈现出不同花色的菜花。 相比白菜花， 黄菜花因含有更高水平的植物色素， 具有 更多的营养价 值。 因此， 选 育黄色菜花品种具有很高的实用价 值。 [0003]研究表明菜花中Pr基因编码的蛋白是R2R3  MYB， 属于转录因子， 与植物的颜色差 异密切相关。 (Chiu  Li‑Wei,et al.The purple cauliflower  arises from activation   of a MYB transcription  factor.[J].Plant  Physiol,2010,154:1470 ‑80.)。 Or基因编码 具有富含DnaJ  Cys结构域的蛋白， 控制菜花有色体的形成， 影响叶片颜色。 (Lu  Shan,et  al.The cauliflower  Or gene encodes a DnaJ cysteine ‑rich domain‑containing   protein that mediates  high levels of beta‑carotene  accumulation.[J].Plant   Cell,2006,18:3594 ‑605.)。 通过基因组测序， 与参考基因组相比， 寻找黄色菜花所具有的 特征SNP变异及InDel变异， 进行BSA关联分析， 特别是针对Pr和Or基因上的多态位点进行菜 花颜色关联分析， 可以鉴定 到与黄色菜花相关的多态性 位点。 [0004]竞争性等位基因特异PCR(KASP)技术是近年来应用广泛的先进的分子标记技术， 可以对基因组(DNA)中SNPs和特定位点上的InDels进行精准的双等位基因判断。 KASP技术 检测分子标记的方法是一种低成本、 高通量的新型快捷的鉴定方法， 在作物育种中应用较 为广泛。 然而目前尚缺少够区分黄 色菜花品种的KASP分子标记。 因此， 开 发菜花黄 色颜色相 关基因的KASP分子标记对于推广普及分子标记技术的应用， 以及提高我国黄 色菜花育种效 率和育种水平具有重要意 义。 发明内容 [0005]鉴于现有技术中的上述缺陷或不足， 期望提供与菜花黄色颜色相关的分子标记及 其应用。 [0006]本发明进一步提供了一种与黄色菜花颜色相关的分子标记， 所述分子标记的序列 如SEQ ID NO:1所示， 其中， 在所述SEQ  ID NO:1第102bp处发生Ins/Del突变(Ins   TGAGACACT/Del  TGAGACACT)突变， 第102bp处碱基为 Ins TGAGACACT时菜花颜色为黄色； [0007]如SEQ ID NO:2所示， 其中， 在所述SEQ  ID NO:2第151bp处发生C/T突变， 第151bp 处碱基为C C时菜花颜色为黄色； [0008]一种扩增 与菜花黄色颜色相关的分子标记的KASP引物， 所述KASP引物包括上游引 物1、 上游引物2以及下游引物， 其中， SEQ  ID NO:1上游引物1的序列如SEQ  ID NO:3所示， 上 游引物2的序列如SEQ  ID NO:4所示， 下游引物的序列如SEQ  ID NO:5所示。 [0009]本发明中， 进一步的， 所述KASP引物包括上游引物1、 上游引物2以及下游引物， 其说　明　书 1/17 页 3 CN 114736980 A 3