(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210264086.3 (22)申请日 2022.03.17 (71)申请人 天津科润农业科技股份有限公司 地址 300457 天津市滨 海新区经济技 术开 发区黄海路276号泰达中小企业园2号 楼310号 申请人 天津市农业科 学院　 承德市农林科 学院 (72)发明人 牛国保　姚星伟　闫丽　孙德岭　 陶秀娟　乔军　董岩　刘莉莉　 文正华　单晓政　张小丽　江汉民　 (74)专利代理 机构 天津市鼎拓知识产权代理有 限公司 12 233 代理人 朱丽丽(51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 与紫色菜花颜色相关的分子标记及其应用 (57)摘要 本发明公开了一种扩增与菜花紫色颜色相 关的分子标记的KASP引物， 所述KASP引物包括上 游引物1、 上游引物2以及下游引物， 其中， SEQ  ID  NO:1上游引物1的序列如SEQ  ID NO:5所示， 上游 引物2的序列如SEQ  ID NO:6所示， 下游引物的序 列如SEQ ID NO:7所示。 可在幼苗阶段对菜花颜 色进行准确预测， KASP基因分型技术可以大批量 检测应用， 有助于提高紫色菜花品种的鉴定效 率， 缩短鉴定时间。 权利要求书1页 说明书20页 序列表3页 附图4页 CN 114410829 A 2022.04.29 CN 114410829 A 1.与紫色菜花颜色相关的分子标记， 其特征在于， 所述分子标记的序列如SEQ  ID NO:1 所示， 其中， 在所述SEQ  ID NO:1第51bp处发生T/A突变， 第51bp处碱基为T时菜花颜色为紫 色； 如SEQ ID NO:2所示， 其中， 在所述SEQ  ID NO:2第56bp处发生A/DelA突变， 第56bp处碱 基为AA时菜花颜色为 紫色； 如SEQ ID NO:3所示， 其中， 在所述SEQ  ID NO:3第52bp处发生Ins/Del突变， 第56bp处 碱基为Ins/Ins时菜花颜色为 紫色； 如SEQ ID NO:4所示， 其中， 在所述SEQ  ID NO:4第102bp 处发生Ins/Del突变， 第102bp 处碱基无法扩增时菜花颜色为 紫色。 2.根据权利 要求1所述的分子标记的KASP引物， 其特征在于， 所述KASP引物包括上游引 物1、 上游引物2以及下游引物， 其中， SEQ  ID NO:1上游引物1的序列如SEQ  ID NO:5所示， 上 游引物2的序列如SEQ  ID NO:6所示， 下游引物的序列如SEQ  ID NO:7所示。 3.根据权利要求2所述的KASP引物， 其特征在于， SEQ  ID NO:2上游引物1的序列如SEQ   ID NO:8所示， 上游引 物2的序列如SEQ  ID NO:9所示， 下游引 物的序列如SEQ  ID NO:10所 示。 4.根据权利要求2所述的KASP引物， 其特征在于， SEQ  ID NO:3上游引物1的序列如SEQ   ID NO:11所示， 上游引物2的序列如SEQ  ID NO:12所示， 下游引物的序列如SEQ  ID NO:13所 示。 5.根据权利要求2所述的KASP引物， 其特征在于， SEQ  ID NO:4上游引物1的序列如SEQ   ID NO:14所示， 上游引物2的序列如SEQ  ID NO:15所示， 下游引物的序列如SEQ  ID NO:16所 示。 6.根据权利 要求2所述的KASP引物， 其特征在于， 所述KASP引物在鉴定与菜花叶片颜色 相关的SNP多态性及基因型产品中的应用。 7.根据权利要求1所述的分子标记， 其特 征在于， 该分子标记在菜花育种中的应用。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114410829 A 2与紫色菜花颜色相关的分子标记及其应用 技术领域 [0001]本发明涉及 生物分子检测及育种领域， 具体涉及与紫色菜花颜色相关的分子标记 及其应用。 背景技术 [0002]菜花， 又称花菜、 花椰菜或椰菜花， 是一种美味且富含营养的常见蔬菜。 菜花叶片 颜色不同， 呈现出不同花色的菜花。 相比普通的 白色菜花， 紫菜花因含有 更高水平的植物色 素， 具有更多的营养价 值。 因此， 选 育紫色菜花品种具有很高的实用价 值。 [0003]研究表明菜花中紫色(Pr)基因突变后可以呈现出强烈的紫色突变表型。 Pr基因编 码的蛋白是R2R3  MYB， 属于转录因子， 与植物的颜色差异密切相关。 (Chiu  Li‑Wei,et  al.The purple cauliflower  arises from activation  of a MYB transcription   factor.[J].Pl ant Physiol,2010,154:1470 ‑80.)。 Or基因编码具有富含DnaJ  Cys结构域 的蛋白， 控制菜花有色体的形成， 影响叶片颜色。 (Lu  Shan,et al.The cauliflower  Or  gene encodes a DnaJ cysteine ‑rich domain‑containing  protein that mediates   high levels of beta‑carotene  accumulation.[J].Plant  Cell,2006,18:3594 ‑605.)。 通过基因组测序， 与参考基因组相比， 寻找紫色菜花所具有的特征SNP变异及InDel变异， 进 行BSA关联分析， 特别是针对Pr和Or基因上的多态位点进 行菜花颜色关联分析， 可以鉴定到 与紫色菜花相关的多态性 位点。 [0004]竞争性等位基因特异PCR(KASP)技术是近年来应用广 泛的、 先进的分子标记技术， 可以对基因组(DNA)中SNPs和特定位点上的InDels进行精准的双等位基因判断。 KASP技术 检测分子标记的方法是一种低成本、 高通量的新型快捷的鉴定方法， 在作物育种中应用较 为广泛。 然而目前尚缺少够区分紫色菜花品种的KASP分子标记。 因此， 开 发菜花紫色颜色相 关基因的KASP分子标记对于推广普及分子标记技术的应用， 以及提高我国紫色菜花育种效 率和育种水平具有重要意 义。 发明内容 [0005]鉴于现有技术中的上述缺陷或不足， 期望提供与一种与紫色菜花颜色相关的分子 标记及其应用。 [0006]本发明进一步提供了一种与紫色菜花颜色相关的分子标记， 所述分子标记的序列 如SEQ ID NO:1所示， 其中， 在所述SEQ  ID NO:1第51bp处发生T/A突变， 第51bp处碱基为T时 菜花颜色为 紫色； [0007]如SEQ ID NO:2所示， 其中， 在所述SEQ  ID NO:2第56bp处发生A/DelA突变， 第56b p 处碱基为A A时菜花颜色为 紫色； [0008]如SEQ ID NO:3所示， 其中， 在所述SEQ  ID NO:3第52bp处发生Ins/Del突变(Ins   GCCATC/Del GCCATC)， 第5 6bp处碱基为 Ins/Ins时菜花颜色为 紫色； [0009]如SEQ ID NO:4所示， 其中， 在所述SEQ  ID NO:4第102bp处发生Ins/Del突变， 第说　明　书 1/20 页 3 CN 114410829 A 3