(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210247033.0 (22)申请日 2022.03.14 (71)申请人 湖北省农业科 学院经济作物研究所 地址 430000 湖北省武汉市洪山区南湖瑶 苑 (72)发明人 易丽聪　戴照义　张毅　王运强　 周伟　邱益纯　 (74)专利代理 机构 武汉仁合利泰专利代理事务 所(特殊普通 合伙) 42275 专利代理师 郑飞 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种与西瓜卷须退化和自封顶相关的分子 标记及其应用 (57)摘要 本发明公开了一种与西瓜卷须退化和自封 顶相关的分子标记及其应用。 本发 明对西瓜卷须 退化且自封顶材料TL ‑DF和正常卷须无限生长 型 材料三白瓜进行全基因组测序， 通过与参考基因 组97103v2的序列比较开发SNP和INDEL分子标 记， 利用T L‑DF和三白瓜杂交再分别构建BC1和F2 分离群体， 发现卷须退化和自封顶性状共同出 现， 由同一个基因位点控制。 通过BSA ‑seq方法将 卷须退化和自封顶基因初步定位于西瓜4号染色 体， 进而利用BC1分离群体对卷须退化和自封顶 基因进行精细定位， 开发出与两个性状共分离的 分子标记ID_PB3。 通过实验证明： 本发明的分子 标记ID_PB3在西瓜自然群体中与卷须退化和自 封顶性状共分离， 可以用于西瓜的分子标记辅助 育种。 权利要求书1页 说明书11页 附图1页 CN 114807409 A 2022.07.29 CN 114807409 A 1.一种与西瓜卷须退化和自封顶相关的分子标记方法， 其特征在于， 所述分子标记为 ID_PB3， 其特异性引物序列和扩增的目的片段长度如下： 正向引物序列为GAT TATAACTTGAAAACAAAACACATGAGTG G， 反向引物序列为T TTTTCTCTTTTTGTGAGTTCAATGTAGCCTG， 扩增长度为121bp或124bp。 2.一种与西瓜卷须退化和自封顶相关的分子标记方法， 其特征在于： 该方法包括以下 步骤： (1)DNA提取， 使用权利要求1中所述的分子标记ID_PB3对群体单株的基因型进行分子 检测； (2)对检测结果进行分析： 若待测西瓜的核苷酸序列为序列表中的序列1， 则待测西瓜为有卷须无限花序西瓜品 种； 若待测西瓜的核苷酸序列为序列表中的序列2， 则待测西瓜为无 卷须自封顶西瓜品种。 3.一种如权利要求1至2任一项所述的与西瓜卷须退化和自封顶相关的分子标记方法 在西瓜育种中的应用。 4.一种如权利要求1至2任一项所述的与西瓜卷须退化和自封顶相关的分子标记方法 在鉴定或辅助鉴定待测西瓜的卷 须有无和是否自封顶中的应用。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114807409 A 2一种与西瓜卷须退化和自封顶相关的分子标记及其应用 技术领域 [0001]本发明属于西瓜分子育种技术领域， 具体涉及一种与西瓜卷须退化和自封顶相关 的分子标记及其应用。 背景技术 [0002]西瓜(Citrullus  lanatus)是一种重要的经济作 物， 在全球范围内广泛 栽培。 根据 联合国粮农组织数据库(FAOSTAT)统计， 2018年我国栽培面积 达151.0万hm2， 占全球总面积 的46.58％， 总产量超6000万t， 占世界总产量的60.64％。 西瓜产业已成为我国农业经济发 展的重要支 柱产业之一。 [0003]西瓜是一种蔓生葫芦科作物， 正常情况下每一片叶的叶腋处均产生一条侧 蔓， 其 花序为无限生长型。 大量分枝和无限生长使得西瓜生产中需要花费大量时间和劳动进 行整 枝、 打顶。 因此， 对西瓜株形进 行改良， 培育少分枝、 自封顶类型新品种是实现西瓜轻简化栽 培的一个重要手段。 在葫芦 科作物中， 对自然封顶(自封顶)性状的研究非常少， 同时该性状 在生产中应用也较少， 目前仅在黄瓜中少量应用。 本发明前期获得一株西瓜卷须退化且自 封顶突变材料， 经过连续7代自交获得稳定遗传的卷须退化和自封顶自交系， 命名为TL ‑DF。 进一步分析自封顶性状的遗传， 对自封顶相关基因进 行定位并开 发分子标记将极大的促进 西瓜自封顶新品种的分子 育种， 为西瓜的轻简化栽培提供品种储备。 [0004]与传统育种相比， 分子标记辅助选择可以在苗期实现对目标性状的选择， 具备稳 定性好、 灵敏度高、 操作简单的优点， 同时可大大减少劳动量、 缩短育种周期、 提高育种效 率。 解析西瓜卷须退化和自封顶性性状的遗传， 开发稳定可靠的分子标记是未来对西瓜株 型进行改良和分子辅助育种的重要工作。 目前西瓜的卷须退化和自封顶性状调控机理尚不 清楚， 需要 进一步开展基因定位， 开发与该性状紧密连锁的育种分子标记。 发明内容 [0005]为提高西瓜株形改良效率， 本发明提供一种与西瓜卷须退化和自封顶性状相关的 InDel分子标记(insertion ‑deletion， 插入缺失)。 本发明以卷须退化且自封顶的西瓜材料 TL‑DF和正常卷须无限生长型材料三白瓜杂交分别构建BC1和F2分离群体， 鉴定两个性状的 关联性、 对卷须退化和自封顶相关基因开展精细定位并开发出与卷须退化和自封顶性状紧 密连锁的InDel分子标记， 利用该InDel分子标记可以实现在苗期准确快速鉴定出西瓜的卷 须是否退化和生长类型(自封顶或无限生长型)， 可提高西瓜 株形改良效率。 [0006]本发明的目的是提供一种与西瓜卷 须退化和自封顶性状相关的I nDel分子标记。 [0007]本发明的另一目的是提供一种检测上述 InDel标记的引物组。 [0008]本发明的再一个目的是提供一种苗期鉴定西瓜卷 须退化和自封顶性状的方法。 [0009]本发明的再一个目的是提供一种鉴定西瓜卷 须是否退化和生长类型的产品。 [0010]本发明的再一个目的是提供上述InDel分子标记在西瓜株形分子辅助选择育种的 应用。说　明　书 1/11 页 3 CN 114807409 A 3