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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210235429.3 (22)申请日 2022.03.11 (71)申请人 丽水市质量检验检测研究院 地址 323000 浙江省丽水市莲都区中山 街 北395号 (72)发明人 章小洪 陈卫平 卢光英 陈梦  姜川 刘杨春 汪昕 贺云鹏  (74)专利代理 机构 杭州君度专利代理事务所 (特殊普通 合伙) 33240 专利代理师 郑芳 (51)Int.Cl. C12Q 1/689(2018.01) C12Q 1/6851(2018.01) C12N 15/11(2006.01) C12R 1/42(2006.01) (54)发明名称 基于ttr基因的沙门氏菌检测试剂盒及非诊 断性检测方法 (57)摘要 本发明涉及一种基于ttr基因的沙门氏菌检 测试剂盒及非诊断性检测方法, 试剂盒含有以下 特异性引物: 上游 外引物F3如SEQ  ID NO.1所示, 下游外引物B3如SEQ  ID NO.2所示, 上游内引物 FIP如SEQ  ID NO.3所示, 下游内引物BIP如SEQ   ID NO.4所示, 上游环引物LF如SEQ  ID NO.5所 示, 下游环引物LB如SEQ  ID NO.6所示。 本发明设 计一条特有的LA MP引物对沙门氏菌进行检测, 同 时结合短时间增菌和MPN计数建立了mini ‑MPN‑ LAMP沙门氏菌 快速定量检测方法; 本发明灵敏度 高, 特异性好, 操作简单快速, 准确可靠, 检测成 本低。 权利要求书1页 说明书5页 序列表2页 附图1页 CN 114717341 A 2022.07.08 CN 114717341 A 1.一种基于t tr基因的沙门氏菌检测试剂盒, 其特 征在于含有以下 特异性引物: 上游外引物F3如SEQ  ID NO.1所示, 下游外引物B3如SEQ  ID NO.2所示, 上游内引物FIP 如SEQ ID NO.3所示, 下游内引物BIP如SEQ  ID NO.4所示, 上游环引物LF如SEQ  ID NO.5所 示, 下游环引物LB 如SEQ ID NO.6所示。 2.根据权利要求1所述基于ttr基因的沙门氏菌检测试剂盒, 其特征在于: 所述试剂盒 包括多孔板、 无菌离心管、 BPW培养液、 无菌生理盐水、 对照标准菌株DNA、 LAMP反应体系试 剂。 3.一种权利要求1所述基于ttr基因 的沙门氏菌检测试剂 盒的非诊断性检测方法, 其特 征在于包括下述 步骤: (1)制作检测沙门氏菌的环介导 等温扩增试剂盒; (2)样品制备和DNA提取; (3)进行沙门氏菌的环介导等温扩增反应: 按照LAMP反应体系对每个提取样品进行检 测, 依次确证沙门氏菌阳性管 数; (4)沙门氏菌MPN的报告: 按照确证的沙门氏菌阳性管数, 检索MPN表, 报告每g或每mL样 品中沙门氏菌的MPN 值。 4.根据权利要求3所述基于ttr基因 的沙门氏菌检测试剂 盒的非诊断性检测方法, 其特 征在于LAMP反应体系为: 10X  ThermoPol  Buffer 2 μL, MgSO4 1.2 μL, dNTP  Mixture 2.8 μL, 50X LAMP荧光染料0.2μL, ROX参比荧光染料0.2μL, 10X  Primers Mix 2μL, Bst 2.0  WarmStar t DNA聚合酶0.8 μL, DNA粗 提液5 μL, 加无RNA酶水至20 μL。 5.根据权利要求3所述基于ttr基因 的沙门氏菌检测试剂 盒的非诊断性检测方法, 其特 征在于LAMP反应条件为: 65℃保温反应40min, 以1min作1个循环检测荧光值, 结束后按65~ 95℃, 0.2℃/s测定溶解曲线。 6.根据权利要求3所述基于ttr基因 的沙门氏菌检测试剂 盒的非诊断性检测方法, 其特 征在于步骤(2)具体为: (a)样品的前处 理: 无菌操作称取样品, 置于盛有BPW的无菌均质杯或合适容器内, 均质; 若样品为液态, 不 需要均质, 振荡混匀; 使用BPW增 菌液对样 品均液进行10倍梯度稀释, 取3个浓度, 每个浓度 分别取1mL至 3个离心管, 置 于36℃增菌5h后分别进行DNA提取; (b)待测样品模板DNA的制备: (b‑1)对照标准菌株菌液制备: 沙门氏菌标准菌株的DNA作阳性对照, 大肠埃希氏菌DNA 作为阴性对照, 标准菌株接种于血平板中36℃培养24h进行活化, 再接种于BPW培养基中36 ℃培养16h得到新鲜菌液; (b‑2)样品与对照菌株的模板DNA制备: 采用快速煮沸法提取核酸, 吸取1mL样液于 12000r/min离心 5min, 移去上清液9 00 μL, 加入1mL无菌 水后混匀再 12000r/min离心 5min, 移 去上清液900 μL, 置于100℃电热板中加热15min, 迅速冷却后12000r/min离心1min, 移取上 清液直接用于LAMP实验; 上清即作为模板DNA。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114717341 A 2基于ttr基因的沙门氏菌检测试剂盒及非诊断性检测方 法 技术领域 [0001]本发明属于食品微生物技术领域, 涉及一种食品微生物检测试剂盒及其检测方 法, 具体地说是 涉及一种基于t tr基因的沙门氏菌检测试剂盒及非诊断性检测方法。 背景技术 [0002]基因的选择对于沙门氏菌的鉴定至关重要。 invA基因是沙门氏菌属检测最常用的 目标基因。 该基因编 码位于沙门氏菌致病岛(SPI)上的入侵蛋白, 在沙门氏菌致病过程中起 着重要的作用, 是侵袭宿主细胞所需的毒力因子, 大多数已发表的文献和商品化的试剂盒 都以invA基因作为靶基因进行检测。 [0003]近年来, TURKI等 发现分离出的12.3%的S.enterica  serovar Kentucky分离株无 法检测出invA基因, 另外, S.enterica  serovar Litchfield和 Senftenberg等菌株在自然 界中也可能会缺 失invA, 通过生物信息学分析和综合测试评价 发现invA在沙门氏菌中的特 异性能只能达 到97.6%~ 97.8%。 [0004]根据沙门菌属特有的靶序列肠毒素基因序列, 设计2对特殊的内、 外引物(内引物 FIP与BIP, 外引物F3与B3), 特异性识别靶序列上的六个独立区域, 为增加反应速度, 还设计 1对环引物(LF与LB)。 利用Bst  DNA聚合酶启动循环链置换反应, 在肠毒素基因序列启动互 补链合成, 在同一链上 互补序列周而复始形成有很多环的花椰菜结构的茎环DNA混合物; 从 dNTP析出的焦磷酸根离子与反应溶液中的Mg2+结合, 产生副产物(焦磷酸镁)形成白色沉淀, 同时反应液pH会降低, 最终可通过颜色变化观察判定结果。 [0005]MPN计数法是一种基于概率计算的计数方法, 使用上比平板计数法更具灵活性, 对 培养基的选择性要求低, 检出限可根据加样量进 行调整, 因此MPN计数法广泛用于食品中大 肠菌群、 金黄色葡萄球菌和单增李斯特菌等微生物的定量检测。 虽然国家标准GB  4789.4‑ 2016 《食品安全国家标准食品微生物学检验沙门氏菌检验》 中未制定沙门氏菌的定量检测 方法, 但在美国分析化学家协会(AOAC)、 美国环保局(EPA)等机构制定的国际标准中均有沙 门氏菌MPN计数法的使用, 可见MPN计数法在定量检测沙门氏菌的重要地位; 但是, 试管法的 MPN计数法操作繁杂, DNA提取需要 进行浓缩, 时间较长 。 发明内容 [0006]为了克服现有技术存在的不足, 本发明提供了一种基于ttr基因的沙门氏菌检测 试剂盒及非诊断性检测方法。 [0007]本发明所采用的技 术方案为: [0008]一种基于t tr基因的沙门氏菌检测试剂盒, 含有以下 特异性引物: [0009]上游外引物F3: 5 ’ ‑TCAGTGGCTAAAAGTCGGTC‑3’; [0010]下游外引物B3: 5 ’ ‑CGCACTGTGTC CAACAGC‑3’; [0011]上游内引物FIP: [0012]5’ ‑GTTACCTTGCCGGACGTCCCACTTTTGGTCTGAGCTAC C‑3’;说 明 书 1/5 页 3 CN 114717341 A 3

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