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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利 (10)授权公告 号 (45)授权公告日 (21)申请 号 202210213636.9 (22)申请日 2022.03.07 (65)同一申请的已公布的文献号 申请公布号 CN 114277182 A (43)申请公布日 2022.04.05 (73)专利权人 北京林业大 学 地址 100083 北京市海淀区清华 东路35号 (72)发明人 刘勇 张劲 江文波 李国雷  宋协海 常笑超 赵蕊蕊 贺国鑫  彭玉信 薛敦孟 李世安 张恒月  邢丽霞  (74)专利代理 机构 北京高沃 律师事务所 1 1569 专利代理师 苏士莹 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01)C12N 15/11(2006.01) 审查员 宋梦 (54)发明名称 一种雄性毛白杨母株与后代关系的鉴定方 法及应用 (57)摘要 本发明提供了一种雄性毛白杨母株与后代 关系的鉴定方法及应用, 涉及种质创新技术领 域。 本发明通过创建雄性毛白杨古树优良单株的 叶绿体基因组图谱, 与已发表毛白杨叶绿体基因 组序列进行比对, 筛选出特异性差异 基因位点或 片段, 分别运用不同的分子标记技术, 有效确定 不同种源古树的优良单株与其子代的亲缘关系, 实现毛白杨苗木种源可追溯性, 为良种推广提供 技术保障。 权利要求书2页 说明书12页 序列表6页 附图14页 CN 114277182 B 2022.07.05 CN 114277182 B 1.一种雄性毛白杨母株与后代关系的鉴定方法, 其特征在于, 包括以下步骤: 创建雄性 毛白杨古树优良单株的叶绿体基因组图谱, 与已知的毛白杨叶绿体基因组序列进行比对, 筛选特异性差异基因位点或基因片段作为分子标记位点, 确定不同种源古树的优良单株与 其子代的亲缘关系; 所述 雄性毛白杨古树优良单株的树龄超过10 0年; 其中, 针对昌平区沙岭村古树设计的特异性引物包括SL ‑2F和SL‑2R, 所述SL ‑2F的核苷 酸序列如SEQ  ID NO.1所示, 所述SL ‑2R的核苷酸序列如SEQ  ID NO.2所示, 昌平区沙岭村古 树的特异性位点位置对应于MK251149所示叶绿体全长序列的45825  bp位点处, 其他毛白杨 古树该位点为碱基T, 昌平 区沙岭村古树该位点为碱基G, 昌平区沙岭村古树位于昌平 区沙 岭村, 树龄300 ‑500年, 胸径131.8cm, 树高28.0m, 来自昌平区沙岭村古树及其子代的引物 SL‑2F和SL‑2R的扩增产物能被AfeI或HaeII酶切开, 而来自其他毛白杨的扩增产物不能被 AfeI或HaeI I酶切开; 针对房山区沙窝古树设计 的特异性引物包括SW ‑2F和SW‑2R, 所述SW ‑2F的核苷酸序列 如SEQ ID NO.3所示, 所述SW ‑2R的核苷酸序列如SEQ  ID NO.4所示, 房山区沙窝古树的特异 性位点位置对应于MK251149所示叶绿体全长序列的53517bp位点处, 其他毛白杨古树该位 点为碱基A, 房山区沙窝古树该位点为碱基 G, 房山区沙窝古树位于房山区沙窝村, 树龄100 ‑ 300年, 胸径134.7cm, 树高2 9.0m; 针对大兴前安定古树设计 的特异性引物包括AD ‑2F和AD‑2R, 所述AD ‑2F的核苷酸序列 如SEQ ID NO.5所示, 所述AD ‑2R的核苷酸序列如SEQ  ID NO.6所示, 大兴前安定古树的特异 性位点位置对应于MK251149所示叶绿体全长序列的289  bp位点处, 其他毛白杨古树该位点 为碱基T, 大兴前安定古树该位点为空缺, 大兴前安定古树位于大兴前安定村, 树龄100 ‑300 年, 胸径134.0 cm, 树高28.0m; 针对大兴区大狼垡村古树设计 的特异性引物包括LF ‑2F和LF‑2R, 所述LF ‑2F的核苷酸 序列如SEQ  ID NO.7所示, 所述LF ‑2R的核苷酸序列如SEQ  ID NO.8所示, 大兴大狼垡古树的 特异性位点位置对应于MK251149所示叶绿体全长序列的81862 ‑81863 bp位点处, 其他毛白 杨古树为81863bp缺失, 大兴大狼垡古树为81862 ‑81863 bp缺失, 大兴大狼垡古树位于大兴 大狼垡村, 树龄 300‑500年, 胸径142.0 cm, 树高27.0m; 针对大兴辛房古树设计 的特异性引物包括XF ‑2F和XF‑2R, 所述XF ‑2F的核苷酸序列如 SEQ ID NO.9所示, 所述XF ‑2R的核苷酸序列如SEQ  ID NO.10所示, 大兴辛房古树的特异性 位点位置对应于MK251149所示叶绿体全长序列的64848bp处, 其他毛白杨古树该位点为碱 基C, 大兴辛房古树该位点为碱基T, 大兴辛房古树位于大兴前辛房村, 树龄100 ‑300年, 胸径 138.0cm, 树高28.0m, 来自大兴辛房古树及其子代的引物XF ‑2F和XF‑2R的扩增产物能被 PciI或AflIII酶切开, 而来自其 他毛白杨的扩增产物不能被Pci I或AflIII酶切开; 针对海淀东北义园古树设计的特异性引物包括DBYY ‑1F和DBYY ‑1R, 所述DBYY ‑1F的核 苷酸序列如SEQ  ID NO.11所示, 所述DBYY ‑1R的核苷酸序列如SEQ  ID NO.12所示, 海淀东北 义园古树的特异性位点为对应于MK251149所示叶绿体全长序列的7319 ‑7320 bp位点之间 存在碱基ATTTTT的插入, 其他毛白杨古树无上述插入序列, 海淀东北义园古树位于海淀区 东北义园, 树龄 300‑500年, 胸径134.0 cm, 树高20.8m。 2.根据权利要求1所述的鉴定方法, 其特征在于, 所述雄性毛白杨古树优良单株的性状 包括: 长寿雄 性、 不飞絮 、 不早衰、 健康状态良好、 树干通 直。权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 114277182 B 23.权利要求1~2任一项所述的鉴定方法在追溯毛白杨苗木种源中的应用。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 114277182 B 3

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