(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210066781.9 (22)申请日 2022.01.20 (71)申请人 湖北省农业科 学院畜牧兽医研究所 地址 430064 湖北省武汉市洪山区狮子山 街南湖瑶苑4号 (72)发明人 乔木　武华玉　彭先文　吴俊静　 梅书棋　宋忠旭　孙华　李良华　 赵海忠　周佳伟　张宇　徐忠　 李梓芃　董斌科　 (74)专利代理 机构 北京东方盛凡知识产权代理 事务所(普通 合伙) 11562 代理人 许佳 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01)C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种与猪肉质性状相关的分子标记及其应 用 (57)摘要 本发明公开了一种与猪肉质 性状相关的分 子标记及其应用， 属于分子标记领域。 所述分子 标记的核苷酸如SEQ  ID NO： 1所示， SEQ  ID NO： 1 所示序列的第302bp处存在C/T 突变， 所述突变包 括CC、 CT和TT 三种突变类型， 其中， 当猪个体基因 型为CC型时， 所述猪个体背最长肌大理石纹、 股 二头肌大理石纹和背最长肌肌内脂肪含量均高 于CT型和TT型的猪个体。 本发明还提供了用于检 测该位点的引物对， 并建立了相应的检测方法， 为猪肌肉品质的遗传改良提供了新的分子标记。 本发明可实现对猪肉质性状进行早期选择， 且检 测方法高效、 准确， 从而能加速猪肉质改良的进 程， 提高猪 育种的经济效益。 权利要求书1页 说明书5页 序列表1页 附图1页 CN 114369669 A 2022.04.19 CN 114369669 A 1.一种与猪肉质性状相关的分子标记， 其特征在于， 所述分子标记的核苷酸如SEQ  ID  NO： 1所示， SEQ  ID NO： 1所示序列的第3 02bp处存在C /T突变。 2.如权利 要求1所述的分子标记， 其特征在于， 所述突变包括CC、 CT和TT三种突变类型， 其中， 当猪个体基因型为CC型时， 所述猪个体背最长肌大理石纹、 股二头肌大 理石纹和背最 长肌肌内脂肪含量均高于 CT型和TT型的猪个体。 3.一种扩增权利要求1所述的分子标记的引物对， 其特征在于， 所述引物对为如SEQ  ID  NO： 2所示的上游引物和如SEQ  ID NO： 3所示的下游引物。 4.一种鉴别猪肉质性状的试剂盒， 其特 征在在于， 包括权利要求3所述的引物对。 5.一种鉴别猪肉质性状的方法， 其特 征在于， 包括如下步骤： 以待测猪个体的DNA为模板， 利用权利要求3所述的引物对进行扩增， 获取扩增产物； 对 所述扩增产物进行测序， 分析基因型以及所述基因型与肉质性状的相关性， 进而判断待测 猪个体的猪肉品质。 6.如权利要求5所述的鉴别猪肉质性状的方法， 其特征在于， 扩增体系包括如下组分： DNA 100ng、 PCR mix 25 μL、 上游引物和下游引物各1 μL、 加d dH2O补至总体积5 0 μL。 7.如权利要求5所述的鉴别猪肉质性状的方法， 其特征在于， 扩增程序为： 94℃预变性 3min； 94℃变性3 0s， 56℃退火3 5s， 72℃延伸3 5s， 35个循环； 72℃延伸10mi n； 4℃保存。 8.如权利要求5所述的鉴别猪肉质性状的方法， 其特征在于， 所述猪肉质性状包括： 背 最长肌大理石纹、 股二头 肌大理石纹和背最长 肌肌内脂肪含量。 9.如权利要求1所述的分子标记或权利要求3所述的引物对或权利要求4所述的试剂 盒 或权利要求5所述的方法在辅助猪育种中的应用。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114369669 A 2一种与猪肉质性状相关的分子标记及其应用 技术领域 [0001]本发明涉及分子标记领域， 特别是涉及一种与猪肉质性状相关的分子标记及 其应 用。 背景技术 [0002]猪肉品质是猪的重要经济性状， 提高猪肉品质是现代种猪选育工作的重要目标之 一， 同时也是满足消费者对猪肉风味、 食品健康和营养需求的重要保障。 然而， 由于肉质性 状的复杂性且遗传力偏低， 传统的基于表型选择等遗传改良方法效率低、 成本高； 分子标记 辅助选择(Marker ‑assisted  selection,MAS)的出现大大加速了猪育种的进程， 它是利用 与特定性状相关联的分子标记作为辅助手段进行选择育种， 具有 快速、 准确、 不受环境影响 等优点， 不仅能大 大减少育种的人力物力消耗， 而且能缩短育种时限。 [0003]用于MAS的分子标记包括蛋白质标记， 微卫星标记， 单核苷酸多态性(single   nucleotide  polymorphi sm， 简称SNP)标记等。 SNP标记指由基因组单核苷酸变异引起的DNA 序列多态性， 包括碱基转换、 颠换、 缺失或插入等。 挖掘猪肉质性状相关的SNP， 能有效加快 猪肉质性状的改良进 展， 为养猪业的可持续发展将带来巨大的经济效益。 [0004]胞质5核苷 酸酶1A(cytosolic 5'‑nucleotidase 1A,NT5C1A)基因， 在人的骨骼肌 和小鼠的胫骨前肌表达量较高(Hunsucker  et al.,2001； Sala ‑Newby et al.,1999)； 抗 NT5C1A自身抗体可以作为包涵体肌炎(一种肌肉疾病)的标记物(Amlani  et al.,2019)。 迄 今为止， 尚无有关NT5 C1A基因作为猪肉质性状分子标记的相关报道。 发明内容 [0005]本发明的目的是提供一种与猪肉质性状相关的分子标记及其应用， 以解决上述现 有技术存在的问题， 为猪肉质性状的分子标记辅助育种提供一种新的分子标记。 [0006]为实现上述目的， 本发明提供了如下 方案： [0007]本发明提供一种与猪肉质性状相关的分子标记， 所述分子标记的核苷酸如SEQ  ID  NO： 1所示， SEQ  ID NO： 1所示序列的第3 02bp处存在C /T突变。 [0008]优选的是， 所述突变包括CC、 CT和TT三种突变类型， 其中， 当猪个体基因型为CC型 时， 所述猪个体背最长肌大理石纹、 股二头肌大理石纹和背最长肌肌内脂肪含量均高于CT 型和TT型的猪个体。 [0009]本发明还提供一种扩增所述的分子标记的引物对， 所述引物对为如SEQ  ID NO： 2 所示的上游引物和如SEQ  ID NO： 3所示的下游引物。 [0010]本发明还提供一种鉴别猪肉质性状的试剂盒， 包括所述的引物对。 [0011]本发明还提供一种鉴别猪肉质性状的方法， 包括如下步骤： [0012]以待测猪个体的DNA为模板， 利用所述的引物对进行扩增， 获取扩增产物； 对所述 扩增产物进行测序， 分析基因型以及所述基因型与肉质性状的相关性， 进而判断待测猪个 体的猪肉品质。说　明　书 1/5 页 3 CN 114369669 A 3