(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210057662.7 (22)申请日 2022.01.19 (71)申请人 华中农业大 学 地址 430070 湖北省武汉市洪山区狮子山 街1号华中农业大 学第一综合楼B215 (72)发明人 刘榜　付明　王玉慧　周翔　 刘祖红　王腾飞　储彬彬　张庆德　 (74)专利代理 机构 北京智为时代知识产权代理 事务所(普通 合伙) 11498 代理人 王加岭　杨静 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种与猪胴体性状相关的SNP分子标记及应 用 (57)摘要 本发明提供了一种 与猪胴体性状相关的SNP 分子标记及应用， 属于分子生物学与育种技术领 域。 本发明所述的SNP分子标记位于猪基因组 11.1版本参考序列7号染色体第302 63336位核苷 酸处， 具有G/A多态性， 并且SNP分子标记为AA基 因型个体背膘厚显著低于GG基因型个体， 胴体长 和皮厚显著高于GG基因型个体。 采用本发明的 SNP分子标记可对猪背膘厚、 皮厚和胴体长三个 胴体性状同时开展标记辅助选择， 实施早期选 择， 提高育种效率。 本发明为猪胴体性状的遗传 改良提供了可靠的分子标记， 对猪的遗传改良具 有重要意 义。 权利要求书1页 说明书5页 序列表2页 附图3页 CN 114317779 A 2022.04.12 CN 114317779 A 1.一种与猪胴体性状相关的SNP分子标记， 其特征在于， 该SNP分子标记位于猪基因组 11.1版本参考序列7号染色体第30263336位碱基， 所述第30263336位碱基为G或A， 该突变导 致多态性。 2.如权利 要求1所述的SNP 分子标记， 其特征在于， 含有上述SNP分子标记的核苷酸序列 如SEQ ID NO.1所示， 在该序列第319位碱基R为SNP分子标记位 点， R表示G或A。 3.用于检测如权利要求1所述的SNP分子标记 的引物组， 其特征在于， 其包括内引物对 和外引物对， 所述内引物对的核苷酸序列如SEQ  ID NO.2和SEQ  ID NO.3所示； 所述外引物 对的核苷酸序列如SEQ  ID NO.4和SEQ  ID NO.5所示。 4.一种检测如权利要求1所述的SNP分子标记 的试剂盒， 其特征在于， 所述试剂盒包括 如权利要求3所述引物组。 5.一种检测如权利要求1所述的SNP分子标记的方法， 其特 征在于， 其包括如下步骤： (1)采用如上 所述的引物组对提取的猪的基因 组DNA进行扩增； (2)对PCR扩增产物的多态性 位点进行鉴定 。 6.如权利要求5所述的方法， 其特征在于， 在步骤( 2)中， 所述鉴定的方法采用电泳检 测： 当扩增片段有两条 带， 大小分别为5 52bp和34 4bp， 则待测样品的基因型为G G基因型； 当扩增片段有两条 带， 大小分别为5 52bp和25 5bp， 则待测样品的基因型为A A基因型； 当扩增片段有三条带， 大小分别为552bp、 344bp和255bp， 则待测样品的基因型为GA基 因型。 7.如权利要求1所述的SNP分子标记用于在猪胴体性状标记辅助选择中的应用。 8.如权利要求7所述的应用， 其特征在于， 所述猪胴体性状包括在背膘厚、 皮厚、 胴体长 选择中的应用。 9.权利要求1所述的SNP分子标记、 权利要求3所述引物组、 如权利要求4所述的试剂盒 或如权利要求6或7 所述的方法在猪育种中的应用。 10.如权利要求9所述的应用， 其特征在于， 所述育种为培育具有低猪背膘厚、 皮厚和胴 体长显著增长的优势猪的筛 选。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114317779 A 2一种与猪胴体性状相关的SNP分子标记及应用 技术领域 [0001]本发明属于分子生物学与育种技术领域， 涉及一种与猪胴体性状相关的SNP分子 标记及应用， 具体涉及与猪背膘厚、 皮厚和胴体长性状相关的分子标记及应用。 背景技术 [0002]猪的胴体性状反映猪 的产肉性能， 属于重要的经济性状， 对于这类性状的遗传改 良直接影响生猪生产的经济效益， 这类性状也一直是猪育种中的目标性状。 在猪的胴体性 状中， 瘦肉率是反映猪产肉量的重要指标， 然而瘦肉率的测定一般需要通过屠宰后对胴体 进行剥离， 实施难度较大， 难以进行全群测定， 更无法实施个体选择， 但其与背膘厚、 皮厚、 胴体长及其他胴体性状存在较强相关， 研究表明背膘厚度越厚瘦肉率越低； 相反， 则瘦肉率 越高(Herault  et al.2018)。 在猪的遗传育种中主要以这些相关性状对瘦肉率进行辅助评 定。 因此研究猪的背膘厚、 皮厚和胴体长等胴体性状， 在育种中具有重要研究意 义。 [0003]随着国民生活水平的不断提高， 人们对猪肉的需求量越来越大。 为了提高猪肉产 量， 满足市场需求， 针对胴体性状这类难以度量的性状的遗传改良， 亟需鉴定一些重要的分 子标记， 进 而通过标记辅助选择或基因 组选择进行相关性状的选 育提高。 [0004]本发明基于申请 人课题组构建的大白猪 ×通城猪高代横交资源群体， 通过全基 因 组测序进行胴体性状全基因组关联分析(Genome  wide association  study， GWAS)， 进 一步 对GWAS结果进行分析， 鉴定出一个同时影响背膘厚、 皮厚和胴体长的SNP分子标记。 目前上 述成果尚未 见报道， 因此 该标记的发现对于猪胴体性状的遗传改良具有潜在的重要价 值。 发明内容 [0005]为了解决上述技术问题， 本发明提供一种与猪胴体性状相关的SNP分子标记及其 应用。 [0006]为实现上述目的， 本发明采用以下的技 术方案为： [0007]一种与猪胴体性状相关的S NP分子标记， 该S NP分子标记位于猪基因组11.1版本参 考序列7号染色体第30263336位碱基， 所述第30263336位碱基为G或A， 该突变导致多态性， 优选地， 所述猪胴体性状包括猪背膘厚、 皮厚和胴体长性状。 [0008]本发明基于2 77头资源群体， 通过测定记录胴体性状(背膘厚、 皮厚、 胴体长)， 利用 全基因组测序获取的SNP分型数据进行胴体性状 GWAS研究， 进一步对GWAS结果进 行分析， 最 终鉴定出7号染色体第30263336位核苷 酸位点与猪背膘厚、 皮厚和胴体长性状均显著关联。 研究结果表明， 该SNP位点的多态性为G/A， 并且AA基因型个体背膘厚显著低于GG基因型个 体， 胴体长和皮厚显著高于G G基因型个 体。 [0009]在育种时优选A A基因型， 能显著降低猪背膘厚、 增 加皮厚和胴体长 。 [0010]优选地， 含有上述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ  ID NO.1所示， 在该序列第319 位碱基R为SNP分子标记位 点， R表示G或A。 [0011]用于检测如上所述的与猪胴体性状相关的SNP分子标记的引物组， 其包括内引物说　明　书 1/5 页 3 CN 114317779 A 3