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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210253312.8 (22)申请日 2022.03.15 (71)申请人 东北大学 地址 110819 辽宁省沈阳市和平区文化路3 号巷11号 (72)发明人 杨金柱 陈乐 马春燕 黄艳  瞿明军 曹鹏 冯朝路 覃文军  栗伟  (74)专利代理 机构 沈阳东大知识产权代理有限 公司 21109 专利代理师 李在川 (51)Int.Cl. G06T 7/10(2017.01) G06T 3/40(2006.01) G06N 3/08(2006.01)G06N 3/04(2006.01) G06K 9/62(2022.01) G06V 10/774(2022.01) G06V 10/82(2022.01) G06V 10/80(2022.01) (54)发明名称 一种基于深度学习的CT影像全心脏分割方 法 (57)摘要 本发明公开了一种基于深度学习的CT影像 全心脏分割方法; 涉及医学图像领域; 在网络编 码阶段中引入残差模块, 增强了网络捕捉全心脏 子结构特征的能力。 在解码阶段引入基于注意力 机制的多尺度融合模块, 该模块在反卷积之后融 合多尺度特征并进行特征重利用, 更好的融合了 低级特征和高级特征。 同时将加权交叉熵损失函 数和加权DICE损失函数结合解决了类失衡问题, 在分割细 节上起到了良好的驱动作用。 本发明实 现方法简单, 自动将全心脏分成7个子结构, 包括 左心房、 左心室、 左心室心肌、 右心房、 右心室、 肺 动脉、 升动脉, 测试一个数据只需几秒钟, 极大的 减少了医生投入的时间和学习成本, 处理过程不 需要人工交 互, 达到了应用的要求。 权利要求书2页 说明书6页 附图3页 CN 114596317 A 2022.06.07 CN 114596317 A 1.一种基于深度学习的CT影 像全心脏分割方法, 其特 征在于: 包括以下步骤: 步骤1: 输入待分割三维医学图像, 并根据该图像的大小将其定义为大小为C ×H×W3维 特征数组, 表示 为: 图像X(C ×H×W); 步骤2: 对步骤1中待分割图像进行 预处理, 作为训练样本; 步骤3: 建立全心脏分割网络, 利用全心脏分割 网络编码器生成5种不同深度的特征图 Out0, Out1, Out2, Out3, Out4, 解码阶段使用基于注意力机制的多尺度融合模块和深度监督模 块进行特征还原得到特 征图, Y0, Y1, Y2, Y3, Y4; 步骤4: 用训练样本对S3建立的全心脏分割网络进行训练, 得到训练好的深度 卷积神经 网络; 步骤5: 将步骤2预处理后的全心脏CT图像输入步骤4训练好的深度卷积神经网络进行 图像分割, 输出分割 好的全心脏CT图像, 包括7个子结构左心房、 左心室、 左心室心肌、 右心 房、 右心室、 肺动脉、 升动脉。 2.如权利要求1所述的基于深度学习的CT影 像全心脏分割方法, 其特 征在于: 所述步骤1的具体过程为: 数据输入, 输入待分割图像, 并根据将其定义为大小C ×H×W 的3维特征数 组, 表示为: 图像X(C ×H×W); 输入的CT体数据使用常规造影术获得, 每个体数 据都覆盖 了整个心脏的所有子结构, 每 个体数据由M个2D切片组成。 3.如权利要求1所述的基于深度学习的CT影 像全心脏分割方法, 其特 征在于: 所述步骤2的具体过程为: 对输入的CT数据集进行预处理; 对标签数据原始标签值进行 重编码, 对新编码的标签值进行one ‑hot编码; 采用2D卷积方式训练神经网络, 将每个三维 体数据进行2D切片处理, 对 数据进行归一化处理, 得到每个体数据的最大灰度值Amax和最小 灰度值Amin, 根据归一 化公式来更新每 个点的灰度值Anew, 如式(1)所示: 其中, Aold为原始灰度值, 对图像顺时针或逆时针旋转进行 数据增强、 数据缩放操作。 4.如权利要求1所述的基于深度学习的CT影 像全心脏分割方法, 其特 征在于: 所述步骤3的具体过程, 包括以下步骤: 步骤3.1: 对 网络中的编码阶段保留残差网络前四个特征模块, 移除最后的全连接层和 平均池化层, 保留了4个layer层和第一个7 ×7的卷积层和池化层, 每个layer层包含两个残 差模块; 残差模块使用3 ×3大小的卷积核进行卷积操作, 每一个卷积层后紧跟一个BN层和 Relu操作来对所提取的特 征进行归一 化激活处理; 根据步骤1获取的图像X, 将图像X经过提取特征操作改变特征图通道数量, 经过最大池 化操作改变特征图的大小, 得到特征图 再经过layer层, 得到特征图 Outi+1, 其中i为特征图索引, i =1,2,3,4, 所述Outi+1分别为 权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 114596317 A 2步骤3.2: 在解码阶段上采样之后添加基于注意力 机制的多尺度融合模块, 多尺度融合 模块包括两个分支, 一个分支使用3个3 ×3大小的卷积进 行卷积操作, 将三个卷积操作的输 出进行特征融合, 可以提取不同尺度的空间特征, 另一个分支引入1 ×1的卷积层进一步捕 捉额外的空间信息, 结合编码阶段得到的特征图Out0~Out4, 进行上采样操作, 改变特征图大小, 与编码阶 段的特征图依 次进行拼接操作, 加强 图像上下文之间的语义信息, 再经过基于注意力机制 的多尺度融合模块, 改变特征图通道数, 同时注入深度监督机制来放大隐藏层特征, 注入深 度监督机制后输出的特 征图为Y0~Y4, 分别为: 5.如权利要求1所述的基于深度 学习的CT影像全心脏分割方法, 其特征在于: 所述步骤 4的具体过程为: 通过网络计算预测值, 对比预测值和真实值, 真实值即标签数据标注所有 目标相关信息, 通过损失函数计算损失值, 然后进 行反向传播对网络进 行更新, 将更新完成 的训练权 重保存到指定的位置 。 6.如权利要求1所述的基于深度 学习的CT影像全心脏分割方法, 其特征在于: 所述上采 样操作采用双线性插值 算法。 7.如权利要求1所述的基于深度学习的CT影像全心脏分割方法, 其特征在于: 所述2D切 片大小为512 ×512。 8.如权利要求1所述的基于深度 学习的CT影像全心脏分割方法, 其特征在于: 所述添加 注意力机制的具体过程, 包括以下步骤: 步骤3.2.1: 将多尺度语义信息融合模块进行全局平均池化操作, 将空间信息压缩成一 个与通道数等维度的向量, 获得 各个特征通道的注意力权 重; 步骤3.2.2: 为了捕获特征通道之间 的非线性关系, 引入两个全连接层、 relu和sigmoid 两种激活函数, 通过sigmo id实现权 重归一化; 步骤3.2.3: 通过scale操作将权 重与输入特 征图按通道对应相乘。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 114596317 A 3

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