(19)国家知识产权局
(12)发明 专利申请
(10)申请公布号
(43)申请公布日
(21)申请 号 202210172181.0
(22)申请日 2022.02.24
(71)申请人 杭州电子科技大 学
地址 310018 浙江省杭州市下沙高教园区2
号大街
(72)发明人 陈滨 张登峰 魏丹 邵艳利
王兴起
(74)专利代理 机构 杭州君度专利代理事务所
(特殊普通 合伙) 33240
专利代理师 杨舟涛
(51)Int.Cl.
G06T 7/10(2017.01)
G06T 5/50(2006.01)
G06K 9/62(2022.01)
G06V 10/764(2022.01)G06V 10/80(2022.01)
G06V 10/82(2022.01)
G06N 3/04(2006.01)
G06N 3/08(2006.01)
(54)发明名称
一种基于空间信息与特征通道的脑肿瘤医
学图像分割方法
(57)摘要
本发明涉及一种基于空间信息与特征通道
的脑肿瘤医学图像 分割方法, 本发 明提出一种采
用RepVGG和双注意力机制来改进U ‑Net网络。
RepVGG通过支链结构和参数重构化方法使得在
不增加参数的情况下保持良好的模块泛化性能,
该模块可以解决复杂全卷积神经网络存在参数
多, 耗时长等缺点。 注意力机制已经广泛应用于
分割任务中, 其具有自动关注目标并抑制输入图
像中不相关的区域的特点, 双注 意力机制有效的
提取和利用空间中的焦点信息和特征通道之间
的相关信息, 实现精确的小目标分割能力。 本发
明解决了复杂网络模型开销大以及小目标分割
能力弱的局限性, 使 得模型能够获得对病变区域
的精确分割。
权利要求书2页 说明书5页 附图3页
CN 114549538 A
2022.05.27
CN 114549538 A
1.一种基于空间信 息与特征通道的脑肿瘤医学图像分割方法, 其特征在于包括如下步
骤:
步骤1: 将三维的MRI数据集进行 预处理;
步骤2: 经 过上述预处 理步骤处 理后的数据集作为模型训练数据集A;
步骤2‑1: 编码器部分将预处理完成的数据集A中图像x0先经过4次RepVGG卷积模块和下
采样处理实现增加特征通道数量和缩小图片尺 寸的目的, 第5次仅经过1个RepVGG卷积模块
进行处理,每一次处 理得到具有不同图片尺寸和不同特 征通道数的结果gi;
步骤2‑2: 解码器部分将上述第5次的结果g5经过4次上采样和增加双注意力机制的VGG
卷积模块进行处理, 最后经过1 ×1卷积进行特征融合, 得到每个像素属于目标分类的概率
预测值;
步骤2‑3: 通过BCEDiceLoss函数对多区域进行预测结果和真实标签进行计算得到损失
值, 通过反向传播更新步骤2 ‑1和2‑2神经网络的参数; 当BCEDiceLoss函数函数的数值趋于
稳定后, 得到最终的模型参数集 合;
步骤3: 将模型 结构和参数重构减小参数量;
编码器中的RepVGG模块, 通过重构的方式将1x1的支链卷积和恒等映射合并到3x3卷积
堆栈中, 减小模型参数量, 加快模型分割图像速度。
2.根据权利要求1所述的一种基于空间信息与特征通道的脑肿瘤医学图像分割方法,
其特征在于: 所述的将三维的MRI数据集进行 预处理; 具体包括以下步骤:
步骤1‑1: 将三维MRI数据进行二维切片处理, 得到分别为T1,T2,FLAIR, T1CE四个特征
通道的二维图片序列, 并删除其中像素值 为零的图片;
步骤1‑2: 将具有四个特 征通道的二维图片序列进行归一 化处理;
步骤1‑3: 将上述1 ‑2归一化后的二维图片序列进行中心剪裁, 图片大小从240 ×240剪
裁到160×160。
3.根据权利要求1所述的一种基于空间信息与特征通道的脑肿瘤医学图像分割方法,
其特征在于: 步骤2 ‑1中所述采用的RepVGG模块改进编码器的卷积模块, 实现了增加特征信
息量的同时防止梯度消失和梯度爆炸的效果; 每层卷积公式如下;
gi=f(xi)+g(xi)+xi (1)
xi表示第i层卷积的输入, f(xi)表示3x3的卷积操作, g(xi)表示1x1的卷积操作, gi代表
卷积融合后的结果。
4.根据权利要求1所述的一种基于空间信息与特征通道的脑肿瘤医学图像分割方法,
其特征在于: 步骤2 ‑2中所述采用的双注意力机制改进的VGG模块, 实现了使得模型不仅在
空间信息上对目标特征 的提取更加精确, 而且能够充分利用不同通道之间的相关信息; 其
具体为:
g表示编码器的跳跃连接, xl代表上采样后的图像数据, f1和f2表示两个不同的1x1卷
积, f3表示一个1x1卷积和Sigmoi d激活函数和ReLU激活函数的组合, Fsq为全局平均池化卷权 利 要 求 书 1/2 页
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2积, Fex为1x1的卷积和ReLU激活函数, Fscale为矩阵相乘操作。
5.根据权利要求1所述的一种基于空间信息与特征通道的脑肿瘤医学图像分割方法,
其特征在于: 步骤2 ‑3中所述采用BCEDiceLoss损失函数是 因为软骰 子损失和交叉熵损失的
组合可以获得稳定性, 同时因为分割的评估是在三个部分重叠的区域上进行, 因此选择同
时对多区域优化, 公式如下:
L'(x,y)= L'dice(x,y)+0.5 *L'bce(x,y) (4)
L(x,y)= Lwhole(x,y)+Lcore(x,y)+Lenh(x,y) (5)
L'dice表示dice损失函数, L'bce表示交叉损失函数, 两者的组合为BCEDiceLoss; Lwhole整
个肿瘤区域损失函数, Lcore表示肿瘤核心区域损失函数, Lenh表示肿瘤增强区域损失函数; x
表示预测值, y表示标签真实值, L'(x,y)表示单个区域的损失值, L(x,y)表 示三个区域损失
值的组合。
6.根据权利要求1所述的一种基于空间信息与特征通道的脑肿瘤医学图像分割方法,
其特征在于: 步骤3中所述将编码器中的RepVGG模块, 通过重构的方式将1x1的支链卷积和
恒等映射合并到3x3卷积堆栈中; 首先将bn层和conv层转换成一个带有偏 差向量的conv, 将
得到一个3x3卷积核, 两个1x1卷积核, 以及三个偏差值; 再将两个1x1的卷积通过零填充的
方式等价转换为3x3的卷积; 利用公式将三个卷积核叠加为一个3x3的卷积并将三个偏差值
相加; 最终得到为仅有一个3x3卷积的VG G结构, 具体如下:
bn(x*W, μ, σ,γ, β )=(x*W')+b' (7)
Conv(x,w1)+Conv(x,w2)+Conv(x,w3)=Conv(x,w1+w2+w3) (8)
公式(6)和公式(7)中, μ, σ, γ, β 分别表示平均值、 标准偏差和学习的比例因子和偏差,
x为输入的数据, W为bn层的权重, W'为bn和conv层转换后的卷积核的权重, b'为转换后的偏
差, *为卷积操作; ; 公 式(8)中x为输入的数据, w1, w2, w3分别为三个卷积的权重参数, 将三个
卷积进行线性叠加最终得到为仅有一个3x3卷积的VG G结构。权 利 要 求 书 2/2 页
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专利 一种基于空间信息与特征通道的脑肿瘤医学图像分割方法
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