ICS11.100.10 CCSC30 中华人民共和国国家标准 GB/T46943—2025 临床实验室检测和体外诊断系统 病原宏基因组高通量测序性能 确认通用要求 Clinicallaboratorytestingandinvitrodiagnostictestsystems— Generalrequirementsformetagenomicnext-generationsequencingvalidation 2025-12-31发布 2027-01-01实施 国家市场监督管理总局 国家标准化管理委员会发布目 次 前言 Ⅲ ………………………………………………………………………………………………………… 1 范围 1 ……………………………………………………………………………………………………… 2 规范性引用文件 1 ………………………………………………………………………………………… 3 术语和定义 1 ……………………………………………………………………………………………… 4 要求 4 ……………………………………………………………………………………………………… 4.1 性能确认标本的制备 4 ……………………………………………………………………………… 4.2 关键试验环节的性能确认 4 ………………………………………………………………………… 4.3 完整流程的性能确认 7 ……………………………………………………………………………… 4.4 性能确认报告 9 ……………………………………………………………………………………… 参考文献 10 …………………………………………………………………………………………………… ⅠGB/T46943—2025 前 言 本文件按照GB/T1.1—2020《标准化工作导则 第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定 起草。 请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。 本文件由国家药品监督管理局提出。 本文件由全国医用临床检验实验室和体外诊断系统标准化技术委员会(SAC/TC136)归口。 本文件起草单位:中国医学科学院北京协和医院、中国食品药品检定研究院、四川大学华西医院、中 山大学附属第一医院、中国医科大学附属第一医院、中国医学科学院病原生物学研究所、中国科学院微 生物研究所、南方医科大学珠江医院、电子科技大学附属医院·四川省人民医院、广州医科大学附属第 一医院、浙江大学医学院附属第一医院、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所、复旦大学附属华山 医院、北京市医疗器械检验研究院(北京市医用生物防护装备检验研究中心)。 本文件主要起草人:徐英春、黄杰、杨启文、陈勃江、陈培松、张栋、刘东来、王婧、王锐智、任珊珊、 韩晓旭、任丽丽、吴林寰、关文达、蒋黎、周海健、张文宏、周宏伟、陈定强、张杰、肖艳、杨子峰、江娟、艾鹿、 董晓龙、韩东升、赵倩雯、左丽媛、卢昕、胡锦瑞、王会如、邹迎曙。 ⅢGB/T46943—2025 临床实验室检测和体外诊断系统 病原宏基因组高通量测序性能 确认通用要求 1 范围 本文件规定了临床检验实验室开展病原宏基因组高通量测序(metagenomicnext-generationse- quencing;mNGS)前,进行性能确认的相关要求。 本文件适用于临床检验实验室使用高通量测序技术开展mNGS的性能确认。 本文件不适用于采用生物纳米孔、固态纳米孔等为主要技术原理的单分子病原测序的性能确认,也 不适用于采用靶向探针杂交捕获或多重引物扩增技术建立的病原测序的性能确认。 2 规范性引用文件 本文件没有规范性引用文件。 3 术语和定义 下列术语和定义适用于本文件。 3.1 高通量测序 next-generationsequencing;NGS 以一次并行几十万到几百万条核酸分子序列测定和一般读长较短等为标志,适用于DNA的测序 技术。 [来源:GB/T30989—2014,3.19,有修改] 3.2 病原宏基因组高通量测序 metagenomicnext-generationsequencing;mNGS 一种对标本中所有病原微生物的DNA和/或RNA进行无偏倚测序的检测技术。 [来源:ISO/TS24420:2023,3.23,有修改] 3.3 性能确认 validation 通过提供客观证据对特定的预期用途或应用要求已得到满足的认定。 [来源:GB/T19000—2016,3.8.13,有修改] 3.4 测序读长 readlengthofgenesequencing 测序能测得的最长基因片段的长度,通常以碱基数表示。 [来源:GB/T30989—2014,3.24] 3.5 文库 library 通过生物来源的、人工合成的或克隆技术等所得到的一个重建分子群。 示例:基因组文库、互补DNA文库、噬菌体展示肽文库等。 1GB/T46943—2025 [来源:GB/T30989—2014,3.5,有修改] 3.6 生物信息学 bioinformatics 应用信息科学及相关学科的方法和技术,研究和分析生物体系和生物过程中信息存储、处理和传递 的一门交叉学科。 [来源:GB/T29859—2013,2.1.1] 3.7 每百万序列数 readspermillion;RPM 每一百万条测序序列中,比对到目标物种基因组的序列数。 3.8 测序覆盖率 coveragerate 比对到目标物种基因组的序列占该物种参考基因组的比例,测序覆盖率=覆盖区域长度/参考序列 总长度×100%。 [来源:GB/T30989—2014,3.30,有修改] 3.9 相对丰度 relativeabundance 某微生物物种在相应分类(通常分成细菌、真菌、病毒、寄生虫4大类)中的占比。 [来源:ISO/TS24420:2023,3.19,有修改] 3.10 近缘物种 closelyrelatedspecies 在进化树上彼此亲缘关系较近的物种。 3.11 临界点 cut-offvalue 在定性试验中检测反应的某一点,低于此检测反应点的定性检测结果被判定为阴性,而高于此点则 被判定为阳性。 [来源:WS/T505—2017,3.13,有修改] 3.12 实验室背景污染 backgroundlaboratorycontamination 除目标微生物以外,其他可能来自试剂、耗材、人员和实验室空间等的微生物核酸。 3.13 精密度 precision 在规定条件下,对同一或相似被测对象重复测量得到测量示值或测得量值间的一致程度。 [来源:GB/T29791.1—2013,A.3.29] 3.14 重复性 repeatability 在一组测量条件下的测量精密度,包括相同测量程序、相同操作者、相同测量系统、相同操作条件和 相同地点,并且在短时间段内对同一或相似被测对象重复测量。 [来源:GB/T29791.1—2013,A.3.30] 3.15 中间精密度 intermediateprecision 在一组测量条件下的测量精密度,这些条件包括相同的测量程序、相同地点并且对相同或相似的被 测对象在一长时间段内重复测量,但可包含其他相关条件的改变。 [来源:GB/T29791.1—2013,A.3.20] 2GB/T46943—2025