SN 中华人民共和国出入境检验检疫行业标准 SN/T 4714—2016 DNA条形码数据库技术规范 Technical specification for DNA barcodes database 行业标准信息服务平台 2016-12-12发布 2017-07-01实施 中华人民共和国 发布 国家质量监督检验检疫总局 SN/T 4714—2016 前 言 本标准按照GB/T1.1—2009给出的规则起草。 本标准由国家认证认可监督管理委员会提出并归口。 本标准起草单位：中国检验检疫科学研究院、国家质量监督检验检疫总局信息中心、中华人民共和 国广东出人境检验检疫局、中国科学院微生物研究所。 本标准主要起草人：蒋弘山、张燕平、雷荣、岳巧云、马骏、陈克、刘力。 行业标准信息服务平台 1 SN/T4714—2016 DNA条形码数据库技术规范 1范围 本标准规定了DNA条形码的分类代码、实体编码、属性数据的结构、数据库构建、运行与维护等技 术规范。 本标准适用于指导检疫性有害生物DNA条形码数据库建设及数据交换 2规范性引用文件 2 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件，仅注日期的版本适用于本文 件。凡是不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本文件。 GB/T2260一2007中华人民共和国行政区划代码 SN/T4621医学媒介生物标本编码规范 3术语和定义 下列术语和定义适用于本文件、 3.1 DNA条形码 DNA barcode 生物体内能够代表该物种的、标准的、有足够变异的、易扩增的DNA特征片段。 3.2 候选基因candidategenes 使用DNA条形码进行物种鉴别时供选择的基因。理想的候选基因具有如下特点：种间遗传距离 显著大于种内遗传距离，且重叠区小或无。常用的候选基因有线粒体细胞色素C氧化酶I亚基（COI） 基因、rDNAITS序列、质体trnH一psbA序列、叶绿体rbcL序列等 3.3 聚合酶链式反应 polymerase chain reaction PCR 一种分子生物学技术，用于扩增特定的DNA片段。在该反应中，使用与目的DNA序列互补的寡 3.4 测序实验信息 sequencingruninformation 测定DNA条码相关的包含PCR扩增引物、测序引物、实验流程、测序时间、测序机构、测序原始峰 图等的信息。 3.5 凭证标本voucherspecimen 具完备的采集、鉴定信息（采集人、日期、地点、生境、鉴定人、种名等），用于物种复核、引证、溯源并 永久保存的标本（或腊叶标本）。 1 SN/T 4714—2016 3.6 参考物质referencematerial 某些具有确定含量或组分，在实际样品定量/定性测定中用作计算被测物质的组分含量的直接或间 接的参照标准的一类物质。 3.7 标本图片specimenphotograph 反映标本形态学信息的图片，包含宽度、高度、文件类型等信息。 3.8 分类学信息taxonomyinformation 由林奈分类法界定的包括界、门、纲、目、科、属、种的分类学信息。 3.9 分布地点distribution site 包括经度、纬度、海拔的位置集合。 3.10 机构代码 institution code 用于唯一标识检疫系统内部机构或与检疫相关的组织机构的6位数字代码。 3.11 数据库 database 按照数据结构来组织、存储和管理数据的仓库。 3.12 服务器 server 也称伺服器。通常指一个管理资源并为用户提供服务的计算机软件，分为文件服务器、数据库服务 器和应用程序服务器等。运行以上软件的计算机或计算机系统也被称为服务器 3.13 DNA(deoxyriboNucleic acid) 脱氧核糖核酸。 3.14 CO I (cytochrome C oxidase I) 线粒体细胞色素C氧化酶I亚基，为最常见的DNA条形码基因。 3.15 ITS(internal transcribed spacer) 核糖体转录间隔区，常作为植物的DNA条形码基因。 3.16 BOLD(barcodeoflifedata) 学平台 3.17 NCBI(national center for biotechnology information) 美国国家生物技术信息中心。 3.18 ER(entity relationship diagram) 实体关系图，用于设计数据库系统的一种图形表示。 2