ICS 11.220 B 41 团体标准 T/CVMA 45-2020 犬腺病毒 PCR检测方法 Detection of canine adenovirus by PCR 2020-12-22发布 2020-12-22实施 中 国 兽 医 协 会 发布 中国兽医协会 CVMA全国团体标准信息平台 T/CVMA 45-2020 I 前 言 本文件按照 GB/T 1.1 —2020《标准化工作导则 第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定起 草。 请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。 本文件由青岛农业大学提出。 本文件由中国兽医协会归口。 本文件起草单位:青岛农业大学、中国动物卫生与流行病学中心、中国兽医药品监察所、上海基灵 生物科技有限公司。 本文件主要起草人:单虎、于永乐 、王媛媛、印春生、朱旭、张传美、张洪亮。 中国兽医协会 CVMA 全国团体标准信息平台 T/CVMA 45-2020 1 犬腺病毒 PCR检测方法 1 范围 本文件规定了 犬腺病毒 PCR检测方法的材料、操作步骤和结果判定 。 本文件适用于犬 、狐狸等犬科 动物分泌物、组织、粪便等样品中腺病毒核酸的检测 。 2 规范性引用文件 下列文件中的 内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条 款。 其中,注日期的引用文件, 仅该日期对 应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本 文件。 GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法 GB 19489 实验室生物安全通用要求 NY/T 541 兽医诊断样品采集、保存与运输技术规范 3 术语和定义 本文件没有需要界定的术语和定义。 4 缩略语 下列缩略语适用于本文件。 CAV: 犬腺病毒( canine adenovirus ) CAV -1: 犬腺病毒 1型( canine adenovirus type 1 ) CAV -2: 犬腺病毒 2型( canine adenovirus type 2 ) PCR: 聚合酶链式反应( polymerase chain reaction) DNA: 脱氧核糖核酸( deoxyribonucleic acid ) Taq酶: Taq DNA 聚合酶( Taq DNA polymerase ) dNTPs: 脱氧核糖核苷三磷酸( deoxyribonucleoside triphosphate ) 5 试剂和材料 5.1 试剂 5.1.1 总则:除非另有说明,所用试剂均为分析纯,试验用水符合 GB/T 6682 的要求,所有试剂均用 无RNA酶的容器分装 5.1.2 0.9 %生理盐水(按照附录 A.1配制) 5.1.3 dNTPs:各10 mmol/L ,-20 ℃保存 5.1.4 10 %十二烷基硫酸钠(按照附录 A.2配制) 中国兽医协会 CVMA 全国团体标准信息平台 T/CVMA 45-2020 2 5.1.5 蛋白酶 K贮备液(按照附录 A.3配制) 5.1.6 5× TBE电泳缓冲液(按照附录 A.4配制) 5.1.7 Goldview 核酸染料 5.1.8 加样缓冲液(按照附录 A.5配制) 5.1.9 DNA 分子量标准: DL2000 DNA Marker 5.1.10 琼脂糖 5.2 材料 5.2.1 RNase free 离心管: 1.5 mL、10 mL 5.2.2 0.2 mL PCR薄壁管 5.2.3 移液器吸头 :10 μL、200 μ L、1000 μ L 5.2.4 医用棉签 5.3 引物 上游引物 :5’-AGGATGGCCTATACATCGCC -3’;下游引物: 5’- TGGTGAACGGGAAGCTGT - 3’;CAV-1扩增片段 516 bp;CAV-2扩增片段 1038 bp。 6 仪器设备 6.1 生物安全柜或超净工作台 6.2 冰箱: 2 ℃~8 ℃、-20 ℃ 6.3 高压蒸汽灭菌器 6.4 组织研磨仪 6.5 涡旋振荡器 6.6 微量移液器(量程 0.1 μ L~2.5 μL、0.5 μ L~10 μL、10 μL~100 μL、100 μ L~1000 μL) 6.7 基因扩增仪 6.8 高速离心机( 8000 g以上) 6.9 分析天平 6.10 水平电泳仪 6.11 凝胶成像系统 7 样品的采集和前处理 7.1 总则 样品的采集、保存与运输按照 NY/T 541 执行。生物安全要求按照 GB 19489 的规定。 7.2 采样器具处理 医用棉签、离心管及 PBS缓冲液经 119 ℃ ~123 ℃高压蒸汽灭菌 15 min。 7.3 样品前处理 7.3.1 粪便 采集新鲜粪便中间未暴露部分 0.5 g~1 g,放入 10 mL离心管中,加入 5 mL~10 mL 生理盐水稀释, 震荡混匀,将稀释后的样品置于带有冰袋的样品运输箱内,送至实验室, 8000 g离心 5 min,取上清液 中国兽医协会 CVMA 全国团体标准信息平台 T/CVMA 45-2020 3 待检。 7.3.2 肛拭子 将无菌棉签用生理盐水 浸湿后,轻轻旋转插入肛门深处 3 cm~5 cm,稍作停顿并旋转棉签,放入 1.5 mL离心管,加入 1 mL 生理盐水 稀释,震荡混匀后弃去棉签,将稀释后的样品置于带有冰袋的样品运输 箱内,送至实验室, 8000 g离心 5 min,取上清液待检。 7.3.3 组织器官 取0.5 g ~1 g 病死犬或者狐狸的肝、脾、肺、肠等组织器官 ,加入 5mL ~10 mL 生理盐水 ,使用组织 研磨仪研磨匀浆,制成组织悬液,将稀释后的样品置于带有冰袋的样品运输箱内,送至实验室, 8000 g 离心 5 min,取上清液待检。 8 操作方法 8.1 病毒DNA的提取 8.1.1 在样本制备区进行, 采取酚抽提法提取;也可采用其他等效的 DNA提取方法。 8.1.2 取上清液 465 μL,加人 25 μL 10 % 十二烷基硫酸钠和 10 μL 的20 mg/mL 蛋白酶 K,56 ℃水 浴摇床上放置 2 h。 8.1.3 加入等量的饱和酚溶液 500 μL,振荡混匀 20 s,12000 g 离心 5 min,取上清液。 8.1.4 加人等量的酚:三氯甲烷:异戊醇 (25:24:1),振荡混匀 20 s,12000 g 离心 5 min,取上清 液。 8.1.5 再加人等量的三氯甲烷:异戊醇 (24∶1),振荡混匀 20 s,12000 g 离心 5 min,取上清液。 8.1.6 最后加人两倍体积的无水乙醇,上下颠倒混匀, 12000 g 离心 10 min,弃上清。 8.1.7 室温于燥后,加人 50 μL 双蒸水溶解沉淀,即得 DNA模板, -20 ℃贮存备用。 8.1.8 在生物安全柜或超净工作台中提取样品 DNA,提取过程应设立阴性和阳性对照。 8.2 扩增试剂的准备与配制 8.2.1 反应混合物在配制区进行。 8.2.2 每个检测反应体系需要 23 µ L PCR 反应液。按附录 A.6配制反应液,转移反应管至样本制备 区。 8.3 加样 8.3.1 在样本制备区进行。 8.3.2 在上述 8.2.2的反应管中分别加入 8.1.1中制备的 DNA溶液 2 µ L,使每管总体积达到 25 µ L, 记录反应管对应的样品编号。盖紧管盖后,瞬时离心。 8.4 PCR反应 8.4.1 在扩增区进行。 8.4.2 将8.3.2中加样后的反应管放入基因扩增仪中,反应参数设置如下: 首先 94 ℃ 变性 5 min; 再 94 ℃、30 s, 55 ℃、45 s,72 ℃、60 s进行 35个循环;最后 72 ℃、10 min。 8.5 扩增产物电泳检测 8.5.1 在电泳成像区进行。 中国兽医协会 CVMA 全国团体标准信息平台 T/CVMA 45-2020 4 8.5.2 取10 μL PCR 扩增产物和 2 μL加样缓冲液 (6X),混匀后加入一个加样孔。每次电泳同时设标 准DNA Marker 、阴性对照、阳性对照。 8.5.3 设置电压 80 V,电泳 30 min。 8.5.4 电泳结束后由凝胶成像系统观察并拍照记录。 9 结果判定 9.1 结果分析条件设定 经PCR检测, CA V阳性电泳示例见附录 B,CA V -1阳性对照样品可扩增出大小为 516 bp的核酸片 段; CA V -2阳性对照样品可扩增出大小为 1038 bp的核酸片段,且阴性对照样品无扩增条带,否则检测 结果视为无效。 9.2 结果描述与判定 在符合 9.1的条件下,若待检样品扩增出了大小为 516 bp的核酸片段,则初步判定 CAV -1核酸阳性; 若待检样品扩增出了大小为 1038 bp的核酸片段,则初步判定 CAV -2核酸阳性;若待检样品同时扩增出 了大小为 516 bp和1038 bp的核酸片段,则初步判定 CAV -1和CAV -2核酸双阳性;若待检样品无扩增条带 或扩增条带与预期大小不符 ,则判定 CAV核酸阴性。 中国兽医协会 CVMA 全国团体

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